68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 774 aa  1542    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  53.39 
 
 		 763 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  49.87 
 
 		 844 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  55.27 
 
 		 757 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  48.44 
 
 		 855 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  49.19 
 
 		 901 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  48.3 
 
 		 829 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  47.8 
 
 		 931 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  47.09 
 
 		 851 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  48.44 
 
 		 880 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  46.83 
 
 		 859 aa  582  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  43.67 
 
 		 832 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.78 
 
 		 1507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.2 
 
 		 1429 aa  544  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  45.37 
 
 		 872 aa  537  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  42.63 
 
 		 935 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  42.9 
 
 		 941 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  38.84 
 
 		 909 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  39.54 
 
 		 918 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  37.57 
 
 		 904 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  39.06 
 
 		 905 aa  502  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  39.7 
 
 		 899 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  38.33 
 
 		 941 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  38.9 
 
 		 895 aa  458  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  38.79 
 
 		 858 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  41.12 
 
 		 1061 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  35.05 
 
 		 860 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  34.37 
 
 		 860 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  34.92 
 
 		 860 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  35.6 
 
 		 860 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  39.27 
 
 		 971 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  31.39 
 
 		 951 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  36.53 
 
 		 776 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  40.76 
 
 		 868 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  35.92 
 
 		 776 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  37.78 
 
 		 873 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  35.68 
 
 		 773 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  35.32 
 
 		 910 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  33.07 
 
 		 1084 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  29.7 
 
 		 1251 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  29.4 
 
 		 910 aa  306  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  29.34 
 
 		 876 aa  297  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  29.4 
 
 		 894 aa  294  5e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  28.08 
 
 		 916 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  29.6 
 
 		 1107 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  28.44 
 
 		 774 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  25.34 
 
 		 926 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  26.31 
 
 		 914 aa  220  7e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  24.25 
 
 		 916 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  24.63 
 
 		 923 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  27.46 
 
 		 761 aa  170  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  22.64 
 
 		 882 aa  150  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  26.31 
 
 		 910 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  25.27 
 
 		 955 aa  77.4  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.39 
 
 		 734 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.99 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  26.3 
 
 		 949 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  31.03 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  28.67 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  23.08 
 
 		 755 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  42.11 
 
 		 883 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  20.51 
 
 		 831 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  35.04 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  24.72 
 
 		 856 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  24.03 
 
 		 770 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  22.18 
 
 		 757 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  21.2 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>