230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2027 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
240 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  89.96 
 
 
240 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  89.96 
 
 
266 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  89.96 
 
 
266 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  85.83 
 
 
252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  85.42 
 
 
266 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  78.39 
 
 
239 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  68.05 
 
 
242 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 
240 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  67.09 
 
 
346 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  67.09 
 
 
346 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 
336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  67.09 
 
 
344 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 
240 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  59.83 
 
 
240 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  63.04 
 
 
240 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  55 
 
 
240 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  49.79 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  54.74 
 
 
239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  51.29 
 
 
233 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  45.76 
 
 
241 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  52.36 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  45.34 
 
 
242 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 
241 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  45.92 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  52.59 
 
 
233 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.32 
 
 
241 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  47.66 
 
 
237 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  51.07 
 
 
234 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  45.89 
 
 
241 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  50.22 
 
 
248 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  66.89 
 
 
149 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 
228 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 
240 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  44.16 
 
 
233 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  44.16 
 
 
233 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.75 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 
203 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 
203 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  47.84 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 
235 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  44.81 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  36.29 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  35.95 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  35.53 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.76 
 
 
227 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  65.82 
 
 
99 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  30.08 
 
 
234 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  30.08 
 
 
234 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.69 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  30.17 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  31.25 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.54 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  33.01 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.18 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.21 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  36.76 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  30.71 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  30.29 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.65 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  30 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  31.94 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  30.51 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  30.64 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  39.39 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.47 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  28.64 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.05 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  28.84 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  29.54 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  36.92 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>