More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2697 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  42.83 
 
 
911 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  48.53 
 
 
847 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  96.58 
 
 
1111 aa  2111    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  96.58 
 
 
1111 aa  2110    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  74.32 
 
 
895 aa  1306    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  74.33 
 
 
1114 aa  1693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 
1111 aa  2270    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  96.58 
 
 
1111 aa  2108    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  40.65 
 
 
898 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  47.99 
 
 
612 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  48.98 
 
 
587 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  52.26 
 
 
477 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.8 
 
 
1019 aa  314  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 
871 aa  310  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.44 
 
 
1019 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 
875 aa  301  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.74 
 
 
958 aa  300  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 
869 aa  300  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  31.24 
 
 
918 aa  298  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 
923 aa  293  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.7 
 
 
1074 aa  292  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 
1063 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 
1063 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.56 
 
 
1063 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.91 
 
 
1057 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 
851 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.77 
 
 
933 aa  289  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 
853 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.09 
 
 
892 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.56 
 
 
1057 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.14 
 
 
1059 aa  279  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.26 
 
 
868 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 
850 aa  274  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 
850 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 
920 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 
850 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 
850 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.09 
 
 
853 aa  268  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 
920 aa  268  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 
891 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.51 
 
 
853 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.61 
 
 
895 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.85 
 
 
853 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 
895 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 
895 aa  258  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 
895 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.5 
 
 
957 aa  251  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 
979 aa  251  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 
1094 aa  249  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.73 
 
 
852 aa  247  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 
849 aa  243  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.23 
 
 
927 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 
906 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 
947 aa  240  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.62 
 
 
843 aa  240  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.46 
 
 
906 aa  238  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.81 
 
 
920 aa  235  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1779  hypothetical protein  96.36 
 
 
110 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0350078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 
843 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.41 
 
 
962 aa  225  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  27.24 
 
 
1006 aa  225  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.44 
 
 
842 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.36 
 
 
886 aa  222  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.11 
 
 
730 aa  217  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 
968 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 
835 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 
843 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 
845 aa  210  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 
1284 aa  210  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.45 
 
 
928 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  26.27 
 
 
855 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.36 
 
 
901 aa  209  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 
838 aa  209  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.38 
 
 
885 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.74 
 
 
942 aa  208  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  24.82 
 
 
841 aa  205  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.97 
 
 
902 aa  205  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 
910 aa  205  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 
890 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.92 
 
 
845 aa  201  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  26.2 
 
 
981 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 
946 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 
946 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  24.77 
 
 
975 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.32 
 
 
1048 aa  200  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  24.47 
 
 
841 aa  199  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  26.47 
 
 
926 aa  199  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  26.47 
 
 
926 aa  199  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.18 
 
 
822 aa  199  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  24.47 
 
 
841 aa  198  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  26.24 
 
 
921 aa  198  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 
928 aa  197  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 
927 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.1 
 
 
946 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  26.84 
 
 
780 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25.48 
 
 
918 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 
926 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 
928 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  26.71 
 
 
780 aa  196  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  30.42 
 
 
961 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>