More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4792 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  61.6 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  65.56 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  64.78 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  61.32 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  59.57 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  55.07 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  49.35 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  49.15 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  48.56 
 
 		 427 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  46.21 
 
 		 439 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  47.2 
 
 		 440 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  48.12 
 
 		 428 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  46.67 
 
 		 430 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  43.97 
 
 		 393 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  41.13 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 311 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  42.04 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.15 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  38.5 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.16 
 
 		 417 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 683 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 890 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 		 352 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.54 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 503 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 354 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.96 
 
 		 927 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.96 
 
 		 1115 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.96 
 
 		 1119 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.46 
 
 		 1115 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.96 
 
 		 1115 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.96 
 
 		 872 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 898 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  36.16 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  30.56 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 405 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 		 1115 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 		 1124 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 520 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 1101 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 368 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 355 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.04 
 
 		 1099 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 1118 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 387 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.81 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.02 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  26.34 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.22 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 1120 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>