More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0638 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1148 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1164 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.78 
 
 		 1148 aa  755    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  40.29 
 
 		 1157 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1246 aa  767    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1193 aa  692    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1155 aa  682    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  40.29 
 
 		 1169 aa  822    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  45.57 
 
 		 1216 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  47.43 
 
 		 1176 aa  875    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1176 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  41.66 
 
 		 1165 aa  721    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  46.92 
 
 		 1176 aa  870    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  34.97 
 
 		 1175 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  42.87 
 
 		 1168 aa  807    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  47.29 
 
 		 1176 aa  874    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  47.43 
 
 		 1178 aa  874    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  47.43 
 
 		 1176 aa  874    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  46.78 
 
 		 1178 aa  971    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  38.11 
 
 		 1153 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1153 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1148 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1157 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  40.04 
 
 		 1210 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1167 aa  661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1148 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  42.87 
 
 		 1168 aa  807    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  43.06 
 
 		 1179 aa  868    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1188 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  35.19 
 
 		 1169 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  41.07 
 
 		 1176 aa  812    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 		 1149 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  36.44 
 
 		 1160 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  49.92 
 
 		 1161 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  38.46 
 
 		 1188 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  37.55 
 
 		 1192 aa  674    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  36.74 
 
 		 1169 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1192 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  40.12 
 
 		 1158 aa  725    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  42.57 
 
 		 1169 aa  845    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  36.29 
 
 		 1159 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  47.29 
 
 		 1176 aa  874    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  34.88 
 
 		 1162 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 		 1153 aa  686    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  46.26 
 
 		 1218 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  42.42 
 
 		 1183 aa  832    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  35.65 
 
 		 1170 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  42.42 
 
 		 1179 aa  769    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  37.65 
 
 		 1208 aa  708    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  46.52 
 
 		 1265 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  36.43 
 
 		 1234 aa  680    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  35.84 
 
 		 1153 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1134 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  37.34 
 
 		 1198 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1179 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  47.75 
 
 		 1176 aa  876    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  36.66 
 
 		 1150 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.47 
 
 		 1207 aa  755    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  36.31 
 
 		 1157 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1182 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  37.72 
 
 		 1148 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1167 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1211 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  36.92 
 
 		 1054 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  38.8 
 
 		 1160 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1148 aa  665    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1193 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  42.58 
 
 		 1162 aa  866    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  42.77 
 
 		 1162 aa  872    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1143 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1148 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  37.92 
 
 		 1148 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1164 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1166 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1178 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  40.65 
 
 		 1073 aa  786    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  47.47 
 
 		 1165 aa  994    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  36.51 
 
 		 1137 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  39.09 
 
 		 1121 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.46 
 
 		 1162 aa  786    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  39.44 
 
 		 1188 aa  768    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1165 aa  795    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1179 aa  754    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  41.73 
 
 		 1168 aa  756    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  37.91 
 
 		 1222 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1148 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  50.49 
 
 		 1189 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1211 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1160 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1192 aa  701    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.73 
 
 		 1177 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1148 aa  763    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  40.74 
 
 		 1159 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1224 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1148 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1211 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 		 1163 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1212 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1173 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 		 1153 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>