125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1785 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  46.06 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  43.28 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  42.51 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  44.37 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  42.89 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  40.78 
 
 		 422 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  40.05 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  38.72 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  40.41 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  36.14 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  36.47 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  36.43 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.11 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  34.16 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  35.51 
 
 		 229 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.33 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.36 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 449 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.14 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.48 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.63 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.11 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.46 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.36 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.01 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.47 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.65 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  21.73 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.2 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.17 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  21.37 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.11 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>