181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0556 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  100 
 
 		 464 aa  914    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  59.87 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  43.99 
 
 		 502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  41.08 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  44.66 
 
 		 708 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  40.56 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.89 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.08 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  49.17 
 
 		 208 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  48.59 
 
 		 208 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  46.2 
 
 		 199 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  46.47 
 
 		 199 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  45.81 
 
 		 201 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  45.25 
 
 		 201 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  44.38 
 
 		 199 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  44.38 
 
 		 199 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  44.02 
 
 		 203 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  46.5 
 
 		 191 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  41.9 
 
 		 199 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  42.7 
 
 		 199 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  46.15 
 
 		 195 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 265 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  38.22 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  43.29 
 
 		 192 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  40.51 
 
 		 240 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  46 
 
 		 197 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  45 
 
 		 192 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  38.8 
 
 		 260 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  42.5 
 
 		 198 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  42.76 
 
 		 197 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  41.88 
 
 		 198 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  36.65 
 
 		 207 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.62 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  45.65 
 
 		 197 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  37.33 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  34.27 
 
 		 252 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  32.31 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  40 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  42.14 
 
 		 192 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  35.84 
 
 		 250 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  31.82 
 
 		 252 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.13 
 
 		 286 aa  93.6  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  38.16 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  37.68 
 
 		 251 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  35 
 
 		 255 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  34.09 
 
 		 244 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  36.57 
 
 		 245 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  33.74 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  31.58 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.5 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  36.18 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  36.36 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  27.23 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  39.27 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  29.22 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  33.48 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 1015 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  30.91 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  34.18 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 		 1001 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  31.78 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  25.13 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  29.93 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  29.41 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  28.5 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  31.76 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.49 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  27.62 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  31.08 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  35.34 
 
 		 242 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.58 
 
 		 264 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.43 
 
 		 265 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.73 
 
 		 237 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.34 
 
 		 277 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  30.73 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  24.82 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  32.52 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  35.57 
 
 		 284 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 190 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  37.5 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  28 
 
 		 223 aa  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  35.87 
 
 		 124 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  36.3 
 
 		 273 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  32.39 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.46 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.34 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 		 2012 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  31.21 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.77 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>