More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2085 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 501 aa  971    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  67.94 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  70.41 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  66.74 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 476 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  56.03 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  57.94 
 
 		 597 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  55.31 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  57.08 
 
 		 493 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  56.49 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.36 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  56.29 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  55.51 
 
 		 483 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  52.02 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 489 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  54.12 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  53.64 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  53.8 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  51.63 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  52.36 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  52.36 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  54.32 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  50.61 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  52.77 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 465 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 435 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.51 
 
 		 460 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 479 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.37 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.08 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 479 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.53 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.03 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.15 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 462 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.16 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  33.62 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.46 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  27.59 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.43 
 
 		 485 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.02 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.71 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>