187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2536 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2536  rhs protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0466  RHS protein  77.31 
 
 		 572 aa  199  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2537  YD repeat protein  77.19 
 
 		 665 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.424104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1412  hypothetical protein  78 
 
 		 248 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2813  YD repeat-containing protein  53.03 
 
 		 513 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  38.98 
 
 		 1381 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  33.33 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  33.63 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1528 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1433 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  39.66 
 
 		 502 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  32.46 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  34.15 
 
 		 1397 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  34.15 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  34.15 
 
 		 1397 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1397 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  33.05 
 
 		 605 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  34.15 
 
 		 1397 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1509 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  36.56 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  36.13 
 
 		 1377 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  31.09 
 
 		 1390 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1377 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  36.52 
 
 		 312 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  36.52 
 
 		 233 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  36.52 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  32.43 
 
 		 1467 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  33.86 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  31.62 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  33.91 
 
 		 1411 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  33.91 
 
 		 1411 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  32.81 
 
 		 788 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  32.81 
 
 		 788 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1411 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3724  Rhs family protein-like protein  33.61 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0108015  hitchhiker  0.00111387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  35.34 
 
 		 598 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  36.52 
 
 		 1388 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  36.52 
 
 		 1409 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1411 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  36.52 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.91 
 
 		 1411 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  36.52 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  33.91 
 
 		 1411 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  35.66 
 
 		 1410 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1301 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  32.48 
 
 		 1429 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  34.35 
 
 		 1388 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1520 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  30.58 
 
 		 1338 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  34.78 
 
 		 1308 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1551 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  32.54 
 
 		 414 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  33.63 
 
 		 1573 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  34.48 
 
 		 1560 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  31.58 
 
 		 583 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  34.65 
 
 		 1494 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1494 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.33 
 
 		 1365 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1525 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  33.68 
 
 		 1400 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1386 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.36 
 
 		 1892 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.04 
 
 		 1981 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  34.48 
 
 		 1609 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  33.63 
 
 		 738 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  34.19 
 
 		 741 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1390 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.55 
 
 		 1359 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  33.33 
 
 		 1394 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  39.74 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1531 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 867 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  34.92 
 
 		 1626 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  33.02 
 
 		 917 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1550 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  35.65 
 
 		 1426 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1426 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3727  hypothetical protein  38.1 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00259449  hitchhiker  0.0064722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1547 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  35.65 
 
 		 1426 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.13 
 
 		 924 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  30.09 
 
 		 451 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  35.09 
 
 		 1527 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3726  hypothetical protein  33.05 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01295  hitchhiker  0.00196674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1490 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  39.08 
 
 		 1417 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  32.67 
 
 		 1577 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  35.65 
 
 		 1429 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  37.76 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  34.19 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  34.19 
 
 		 764 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  37.76 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  31.54 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1405 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1402 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  33.63 
 
 		 1385 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1198 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  34.55 
 
 		 903 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1418 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  33.91 
 
 		 1399 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>