227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0466 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0466  RHS protein  100 
 
 
572 aa  1143    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2537  YD repeat protein  83.04 
 
 
665 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.424104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2813  YD repeat-containing protein  50.2 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2536  rhs protein  77.31 
 
 
131 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1412  hypothetical protein  77.66 
 
 
248 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  34.11 
 
 
1381 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  35.53 
 
 
1467 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  33.5 
 
 
927 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  32.84 
 
 
690 aa  95.1  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  33.84 
 
 
1572 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  36.71 
 
 
1586 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  31.84 
 
 
1551 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  31.78 
 
 
1386 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  32.66 
 
 
903 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  36.71 
 
 
1595 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.12 
 
 
1547 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  33.18 
 
 
1390 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  35.35 
 
 
1576 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  31.84 
 
 
583 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  31.68 
 
 
451 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  33.5 
 
 
1411 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 
913 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  31.47 
 
 
1400 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  31.92 
 
 
1385 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  31.68 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  31.71 
 
 
1611 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  32 
 
 
867 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  31.96 
 
 
1560 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  32.31 
 
 
1520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  32.67 
 
 
561 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  31.09 
 
 
1409 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  29.96 
 
 
1531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 
1198 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  32.43 
 
 
1550 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 
1527 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  35.12 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  32.08 
 
 
1402 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  32 
 
 
1390 aa  80.9  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  32.07 
 
 
705 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  35.88 
 
 
303 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  32.06 
 
 
1418 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31 
 
 
1348 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  32.44 
 
 
598 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  31.84 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  29.47 
 
 
1433 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  32.2 
 
 
764 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  36.51 
 
 
1528 aa  77  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.77 
 
 
924 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.96 
 
 
1609 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  37.41 
 
 
1583 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  34.69 
 
 
1568 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  36.36 
 
 
171 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  30.59 
 
 
889 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  38.02 
 
 
1509 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  28.57 
 
 
1577 aa  74.7  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.85 
 
 
866 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  35.53 
 
 
1604 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.17 
 
 
1586 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 
1494 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  39.8 
 
 
1525 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  30.2 
 
 
1429 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  32.38 
 
 
1359 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  27.19 
 
 
1384 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  33.97 
 
 
1490 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  31.53 
 
 
1421 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.41 
 
 
1338 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  29.21 
 
 
738 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  29.76 
 
 
741 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  34.23 
 
 
1399 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  38.26 
 
 
1411 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  38.26 
 
 
1411 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  30.43 
 
 
788 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  38.26 
 
 
1411 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  30.43 
 
 
788 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  38.26 
 
 
1411 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  33.33 
 
 
1308 aa  70.5  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  36.57 
 
 
1397 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  38.26 
 
 
1411 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  38.39 
 
 
1388 aa  69.7  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  36.57 
 
 
1397 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  34.46 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  34.85 
 
 
1301 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  36.57 
 
 
1377 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  36.57 
 
 
1397 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  36.57 
 
 
1377 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  38.74 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  38.39 
 
 
1394 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  38.39 
 
 
1409 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  37.39 
 
 
1411 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  36.57 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  38.74 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  35.56 
 
 
1397 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  36.76 
 
 
1410 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  36.8 
 
 
1626 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>