More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1518 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
597 aa  1229    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.92 
 
 
878 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39 
 
 
810 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 
632 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
1737 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
3145 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.8 
 
 
764 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
909 aa  163  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
612 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
718 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.96 
 
 
816 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
828 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
828 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
543 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.18 
 
 
1056 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.95 
 
 
875 aa  153  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.19 
 
 
1022 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
505 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
818 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
789 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.2 
 
 
725 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
480 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
1276 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 
1056 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.78 
 
 
622 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
4489 aa  147  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
448 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
824 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
828 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 
784 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
754 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.24 
 
 
936 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
955 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.87 
 
 
733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
602 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
3035 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
988 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.86 
 
 
837 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.33 
 
 
887 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  26.4 
 
 
467 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
637 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.37 
 
 
1694 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
754 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.31 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
927 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.79 
 
 
594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.71 
 
 
1676 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  24.13 
 
 
604 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
465 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 
689 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
681 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
615 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
732 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.14 
 
 
714 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.43 
 
 
620 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
1094 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.28 
 
 
676 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
3560 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
847 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
503 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
708 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
714 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
601 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
649 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.04 
 
 
535 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
573 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.13 
 
 
626 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.01 
 
 
626 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.13 
 
 
626 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
827 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  23.55 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
1486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
562 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
614 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.5 
 
 
865 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
833 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
715 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
602 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
739 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
620 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
808 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.5 
 
 
397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
1371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
3172 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
608 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.5 
 
 
795 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
3301 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
366 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
833 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.91 
 
 
832 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.79 
 
 
1764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>