More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 426 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  54.91 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  51.09 
 
 		 435 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  49.07 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  43.4 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  42.34 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  29.05 
 
 		 428 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.22 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.7 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.59 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 439 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.69 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 411 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.02 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 436 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.18 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.47 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.66 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  30.3 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.24 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.99 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.78 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.35 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.47 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.34 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.45 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>