More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6521 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 228 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 259 aa  91.7  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  33.11 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  31.77 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  31.43 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  28.5 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>