More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0534 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  884    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  44.85 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  32.32 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.49 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.72 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.42 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 554 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.15 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  23.53 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 446 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  28.14 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  23.7 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  22.58 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.91 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 455 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 456 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.27 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  23.43 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  97.1  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 462 aa  97.1  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 486 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16054  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  23.72 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0679405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 538 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  24.38 
 
 		 546 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 444 aa  94  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 462 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  22.07 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>