More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4063 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  45.29 
 
 		 2961 aa  1275    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  33.56 
 
 		 2350 aa  731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  47.39 
 
 		 2831 aa  1385    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 1763 aa  3596    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4064  YD repeat-containing protein  92.89 
 
 		 201 aa  364  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  48.62 
 
 		 1030 aa  296  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 3073 aa  291  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  45.43 
 
 		 1351 aa  284  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  26.95 
 
 		 2387 aa  272  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  41.71 
 
 		 1750 aa  243  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  43.06 
 
 		 850 aa  233  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  42.43 
 
 		 772 aa  217  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 892 aa  207  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  37.85 
 
 		 439 aa  206  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1051 aa  186  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1352 aa  183  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 963 aa  175  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  38.8 
 
 		 623 aa  164  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1271 aa  164  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.88 
 
 		 2096 aa  162  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.62 
 
 		 646 aa  162  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.63 
 
 		 2296 aa  161  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  36.66 
 
 		 1026 aa  160  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1400 aa  158  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1942 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1611 aa  157  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1669 aa  154  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.24 
 
 		 2277 aa  153  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1917 aa  152  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 3193 aa  151  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1600 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 		 863 aa  149  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.98 
 
 		 1130 aa  148  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.7 
 
 		 1385 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  28.88 
 
 		 788 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  28.88 
 
 		 788 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.38 
 
 		 2149 aa  145  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.82 
 
 		 1292 aa  145  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  32.87 
 
 		 425 aa  143  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1527 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.37 
 
 		 1840 aa  140  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.88 
 
 		 1614 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1959 aa  139  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1409 aa  138  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  28.19 
 
 		 741 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 2035 aa  138  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 732 aa  138  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.84 
 
 		 1586 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.84 
 
 		 1595 aa  137  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.85 
 
 		 1572 aa  135  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1411 aa  135  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  28.37 
 
 		 764 aa  135  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.19 
 
 		 1599 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1551 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.62 
 
 		 1485 aa  132  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.27 
 
 		 1576 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.52 
 
 		 1381 aa  131  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1558 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 770 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 866 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1531 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.52 
 
 		 831 aa  129  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  28.5 
 
 		 705 aa  129  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.69 
 
 		 930 aa  129  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1541 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.89 
 
 		 1518 aa  128  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1541 aa  128  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1541 aa  128  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.11 
 
 		 1568 aa  126  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 756 aa  127  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 		 807 aa  125  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.22 
 
 		 1464 aa  125  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.59 
 
 		 1488 aa  124  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1541 aa  123  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1390 aa  123  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1541 aa  123  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1541 aa  123  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1197 aa  123  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1381 aa  123  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.69 
 
 		 3027 aa  123  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.89 
 
 		 924 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  27.23 
 
 		 738 aa  123  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.89 
 
 		 1384 aa  122  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1509 aa  122  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.51 
 
 		 676 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1550 aa  122  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1495 aa  122  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 927 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1520 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1410 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.33 
 
 		 1489 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1386 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 2294 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  33.69 
 
 		 719 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.85 
 
 		 693 aa  120  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1319 aa  120  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.29 
 
 		 1560 aa  120  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.11 
 
 		 903 aa  120  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 2003 aa  120  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1433 aa  119  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>