More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0798 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  100 
 
 
1538 aa  3023    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  45.37 
 
 
1597 aa  172  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  46.15 
 
 
1141 aa  148  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  36.82 
 
 
2329 aa  123  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.64 
 
 
5098 aa  108  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.83 
 
 
1884 aa  107  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
4334 aa  102  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  48.48 
 
 
4106 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  52.68 
 
 
813 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  47.1 
 
 
219 aa  99.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  39.11 
 
 
2890 aa  99  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.97 
 
 
4978 aa  98.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  34.22 
 
 
2537 aa  97.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  45.14 
 
 
1855 aa  97.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.41 
 
 
2346 aa  95.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 
2704 aa  95.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  43.67 
 
 
1421 aa  95.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.33 
 
 
3314 aa  95.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.21 
 
 
588 aa  95.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.07 
 
 
824 aa  94.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  54.13 
 
 
833 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  50 
 
 
820 aa  93.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.79 
 
 
3427 aa  92.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.6 
 
 
3619 aa  92.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 
709 aa  92  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  46.51 
 
 
1499 aa  91.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.08 
 
 
3619 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  39.86 
 
 
867 aa  90.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
3091 aa  90.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.61 
 
 
11716 aa  90.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.57 
 
 
3608 aa  89.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.02 
 
 
485 aa  89.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  49.54 
 
 
232 aa  89.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50.46 
 
 
260 aa  89  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.54 
 
 
1699 aa  89  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  37.22 
 
 
1814 aa  89  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  46.51 
 
 
1156 aa  88.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  41.25 
 
 
4854 aa  88.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.92 
 
 
202 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  37.22 
 
 
2336 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  52.58 
 
 
1424 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 
202 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  34.83 
 
 
782 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  46.4 
 
 
4798 aa  87.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  48.21 
 
 
3954 aa  87.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.68 
 
 
6211 aa  87  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 
2885 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.11 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.71 
 
 
1236 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  55.36 
 
 
946 aa  86.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.41 
 
 
5745 aa  85.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  32.87 
 
 
1787 aa  85.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.25 
 
 
2816 aa  85.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  47.27 
 
 
2567 aa  85.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  46.36 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  38.59 
 
 
942 aa  85.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  35.03 
 
 
781 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.71 
 
 
2667 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  41.74 
 
 
686 aa  84.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.38 
 
 
2105 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45.87 
 
 
1164 aa  84.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  57.65 
 
 
5839 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  53.27 
 
 
2954 aa  84  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.69 
 
 
855 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  36.59 
 
 
1279 aa  83.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  41.09 
 
 
1022 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  41.09 
 
 
1017 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  44.83 
 
 
850 aa  82.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
396 aa  83.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.89 
 
 
868 aa  83.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  53.57 
 
 
2296 aa  82.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 
1712 aa  82.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.64 
 
 
1795 aa  82.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  44 
 
 
757 aa  82  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  50.54 
 
 
1346 aa  82  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  42.61 
 
 
355 aa  82  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.71 
 
 
950 aa  81.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.55 
 
 
2074 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  45.45 
 
 
219 aa  81.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.27 
 
 
3816 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  45 
 
 
606 aa  81.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 
572 aa  80.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  46.51 
 
 
280 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.57 
 
 
5769 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 
2836 aa  80.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.06 
 
 
2767 aa  80.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  42.97 
 
 
303 aa  80.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.27 
 
 
2678 aa  80.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  42.21 
 
 
1895 aa  80.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.17 
 
 
1963 aa  81.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  43.52 
 
 
1781 aa  80.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  45.87 
 
 
6753 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  40.91 
 
 
959 aa  80.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.6 
 
 
795 aa  80.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  45.05 
 
 
1306 aa  79.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.1 
 
 
2452 aa  79.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  46.61 
 
 
221 aa  79.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  56.25 
 
 
9030 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  44.04 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>