More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0304 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  84.54 
 
 
401 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  100 
 
 
401 aa  823    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  84.54 
 
 
401 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  100 
 
 
401 aa  823    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  30.17 
 
 
372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  29.1 
 
 
374 aa  136  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.03 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  28.19 
 
 
376 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  29.3 
 
 
415 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.12 
 
 
391 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.62 
 
 
369 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.6 
 
 
369 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.05 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.83 
 
 
378 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.79 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.11 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.01 
 
 
392 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.37 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  29.08 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.93 
 
 
325 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.44 
 
 
377 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  28.02 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.67 
 
 
392 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.93 
 
 
363 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.47 
 
 
370 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.58 
 
 
400 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.71 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.57 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  28.42 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  26.15 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.47 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.59 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  34.1 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.76 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.15 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.39 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.07 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  29.44 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.19 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.25 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  28.49 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.76 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.44 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.75 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.96 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.96 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  21.05 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  28.57 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  25.47 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  24.54 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  25.9 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.05 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  24.2 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.64 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  25.9 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.19 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.02 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  33.73 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.42 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  20.69 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.11 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.98 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.43 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  28.33 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.37 
 
 
313 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.37 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.51 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  25.85 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.95 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.25 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.09 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  25.57 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.52 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.27 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.23 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.27 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  23.79 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  30.59 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  24.57 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  23.28 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  25 
 
 
319 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.91 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  25.76 
 
 
319 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  30.81 
 
 
201 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.76 
 
 
297 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.07 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  25.46 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.28 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  24.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  27.51 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>