More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1329 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 395 aa  808    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  89.92 
 
 		 397 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  75.62 
 
 		 392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  72.97 
 
 		 390 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  69.43 
 
 		 393 aa  564  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  72.9 
 
 		 389 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  72.85 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  70.11 
 
 		 390 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  70.72 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  67.87 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  67.45 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  65.7 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  63.71 
 
 		 395 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  63.19 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  62.76 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  63.75 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  60.15 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  59.45 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  59.29 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  50.9 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  52.97 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  37.81 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  36.96 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  36.73 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 		 410 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  35.48 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  36.78 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  37.96 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  34.13 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  34.6 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  31.38 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  31.59 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  32.21 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  28.96 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.64 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  29.28 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  30.4 
 
 		 393 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  26.47 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  26.6 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  26.98 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>