130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0675 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  69.11 
 
 		 2156 aa  2088    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  41.59 
 
 		 5442 aa  953    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  38.93 
 
 		 4830 aa  1115    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  39.42 
 
 		 7434 aa  1099    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  38.65 
 
 		 3864 aa  1113    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 3066 aa  5841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  38.66 
 
 		 1196 aa  447  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  37.98 
 
 		 918 aa  380  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  53.81 
 
 		 1526 aa  339  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  43.89 
 
 		 2768 aa  292  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.8 
 
 		 4480 aa  287  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.43 
 
 		 3227 aa  262  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  33.18 
 
 		 1699 aa  261  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32 
 
 		 2886 aa  248  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  35.55 
 
 		 860 aa  243  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  36.61 
 
 		 954 aa  229  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.26 
 
 		 4697 aa  224  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  37.94 
 
 		 889 aa  219  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  38.18 
 
 		 873 aa  199  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  31.28 
 
 		 2802 aa  196  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  36.64 
 
 		 781 aa  191  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  35.65 
 
 		 790 aa  188  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  35.49 
 
 		 846 aa  188  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  36.55 
 
 		 819 aa  187  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  38.22 
 
 		 3340 aa  186  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.01 
 
 		 3089 aa  184  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  34.58 
 
 		 763 aa  179  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  35.62 
 
 		 770 aa  177  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  36.44 
 
 		 777 aa  176  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  35.18 
 
 		 756 aa  170  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1902 aa  168  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  34.52 
 
 		 764 aa  167  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  33.76 
 
 		 768 aa  163  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  37.86 
 
 		 2820 aa  157  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  38.27 
 
 		 2132 aa  156  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  30.49 
 
 		 768 aa  155  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  36.55 
 
 		 3132 aa  153  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 2194 aa  148  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  32.67 
 
 		 2853 aa  142  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  33.23 
 
 		 2001 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.04 
 
 		 3391 aa  134  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  42.31 
 
 		 1838 aa  124  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  33.88 
 
 		 1359 aa  117  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  45.52 
 
 		 1855 aa  117  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  35.25 
 
 		 3508 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.66 
 
 		 4465 aa  112  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  47.74 
 
 		 1827 aa  112  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.06 
 
 		 6678 aa  111  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 		 8980 aa  110  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.68 
 
 		 3544 aa  108  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  43.92 
 
 		 2207 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.84 
 
 		 2133 aa  107  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  57.58 
 
 		 2193 aa  107  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  39.33 
 
 		 8871 aa  107  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.36 
 
 		 3363 aa  106  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  39.62 
 
 		 2461 aa  106  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.21 
 
 		 16311 aa  106  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 3954 aa  106  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  35.65 
 
 		 852 aa  104  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.29 
 
 		 3699 aa  104  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 4678 aa  103  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  36.69 
 
 		 2503 aa  102  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1151 aa  102  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  42.68 
 
 		 2715 aa  101  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.89 
 
 		 2192 aa  101  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 		 14916 aa  100  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.16 
 
 		 2927 aa  100  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 4334 aa  99.8  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  35.32 
 
 		 3089 aa  99.4  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 		 3699 aa  99.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  34.56 
 
 		 1757 aa  97.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.42 
 
 		 1019 aa  94.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.17 
 
 		 824 aa  94.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  41.45 
 
 		 2042 aa  94  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.73 
 
 		 3477 aa  93.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  35.62 
 
 		 922 aa  92.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.56 
 
 		 2839 aa  91.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.75 
 
 		 9867 aa  87.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  29.27 
 
 		 938 aa  85.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.27 
 
 		 940 aa  84.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3714 aa  84  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  36.96 
 
 		 6276 aa  83.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  32.91 
 
 		 1641 aa  82.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  41.61 
 
 		 492 aa  82  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  31.13 
 
 		 337 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  29.55 
 
 		 308 aa  81.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.53 
 
 		 1627 aa  79  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  27.86 
 
 		 426 aa  78.2  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  41.43 
 
 		 465 aa  78.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.49 
 
 		 3427 aa  77  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.23 
 
 		 2031 aa  74.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  47.78 
 
 		 1848 aa  73.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1538 aa  70.5  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  33.04 
 
 		 4120 aa  67.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  30.3 
 
 		 912 aa  67  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  27.92 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  28.21 
 
 		 1017 aa  66.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2233 aa  64.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  37.11 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 		 917 aa  63.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>