More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0014 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  100 
 
 
453 aa  898    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  53.67 
 
 
453 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  43.33 
 
 
467 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  41.59 
 
 
441 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
467 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.18 
 
 
498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
481 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
486 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
468 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
500 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
500 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
485 aa  156  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
462 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
525 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
475 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
490 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
538 aa  147  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
448 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
454 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
518 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
475 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
455 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.71 
 
 
554 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
461 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  32.1 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.83 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.47 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
505 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.22 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.13 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.22 
 
 
469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.22 
 
 
469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.22 
 
 
469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.22 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
469 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
457 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.98 
 
 
469 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  23.5 
 
 
469 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
469 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
437 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
469 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
469 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
454 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
437 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.3 
 
 
454 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.49 
 
 
463 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.6 
 
 
475 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
450 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.02 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.23 
 
 
460 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
466 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.52 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  23.25 
 
 
480 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
448 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.98 
 
 
469 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.72 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  22.76 
 
 
478 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.85 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.61 
 
 
463 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
457 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
453 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
454 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
484 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.04 
 
 
468 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.49 
 
 
469 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.78 
 
 
492 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
464 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
452 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
464 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
462 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
461 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.64 
 
 
453 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
442 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
524 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
504 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  26.52 
 
 
503 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.54 
 
 
456 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  23.22 
 
 
453 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>