78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2885 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 677 aa  1392    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  59.48 
 
 		 658 aa  804    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  48.24 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  46.39 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  47.41 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  39.73 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  34.81 
 
 		 399 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  34.45 
 
 		 403 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  33.89 
 
 		 407 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  33.25 
 
 		 471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  31.07 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  31.52 
 
 		 408 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 548 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.6 
 
 		 387 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  29.95 
 
 		 597 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  31.3 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.12 
 
 		 693 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 		 411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.93 
 
 		 541 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  30.62 
 
 		 408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  29.3 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.94 
 
 		 567 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  29.81 
 
 		 547 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  28.97 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.73 
 
 		 445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 631 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 		 850 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  26.56 
 
 		 433 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.69 
 
 		 589 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  27.08 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  27.68 
 
 		 636 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  27.85 
 
 		 558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  27.95 
 
 		 427 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  25.39 
 
 		 737 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  26.35 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  26.57 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  27.86 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  26.48 
 
 		 440 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  26.22 
 
 		 727 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  24.07 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.11 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.99 
 
 		 587 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.58 
 
 		 424 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  23.91 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  23.89 
 
 		 450 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  23.84 
 
 		 434 aa  116  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  24.88 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  24.18 
 
 		 445 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.78 
 
 		 435 aa  104  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.44 
 
 		 320 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  24.7 
 
 		 469 aa  90.9  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  24.21 
 
 		 469 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  31.52 
 
 		 693 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  32.24 
 
 		 970 aa  75.5  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 1193 aa  68.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  30.83 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.93 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  27.61 
 
 		 1069 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 1392 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  26.22 
 
 		 1172 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  30.34 
 
 		 1193 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  25 
 
 		 938 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 616 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  34.12 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 		 1424 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.85 
 
 		 1206 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  39.02 
 
 		 2802 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  39.51 
 
 		 649 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  30.07 
 
 		 2142 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  26.95 
 
 		 1295 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  36.92 
 
 		 1991 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.74 
 
 		 887 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.86 
 
 		 1236 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1869 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.27 
 
 		 1108 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  34.34 
 
 		 3563 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  30.25 
 
 		 1119 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  47.83 
 
 		 1848 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>