More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1719 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  61.08 
 
 		 637 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  60.44 
 
 		 681 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 583 aa  1187    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  63.22 
 
 		 603 aa  782    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  65.43 
 
 		 865 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  63.43 
 
 		 909 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  63.4 
 
 		 739 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 612 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  63.33 
 
 		 685 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  58.52 
 
 		 362 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  58.8 
 
 		 750 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  55.25 
 
 		 816 aa  296  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.11 
 
 		 1677 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 955 aa  267  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 662 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 3145 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 653 aa  250  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.51 
 
 		 653 aa  250  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  60 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 714 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.6 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 1827 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 601 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1450 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 649 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 649 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  60.87 
 
 		 425 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 935 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 646 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 636 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 540 aa  232  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 688 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  59.33 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 406 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  55.56 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 740 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.16 
 
 		 577 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.45 
 
 		 1034 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.86 
 
 		 620 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 620 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1005 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 608 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 472 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.11 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 556 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  57.73 
 
 		 235 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.76 
 
 		 626 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 614 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 612 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.88 
 
 		 1077 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 607 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.27 
 
 		 703 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1038 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  49.77 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.72 
 
 		 1764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.96 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 655 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 637 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  63.33 
 
 		 529 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.64 
 
 		 872 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 611 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 767 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.78 
 
 		 733 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 1212 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 		 689 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.43 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1454 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1451 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 		 502 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 502 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.25 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 747 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 545 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>