288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0035 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 546 aa  1096    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  73.59 
 
 		 547 aa  840    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  56.12 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  56.1 
 
 		 546 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  54.72 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  54.55 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  54.55 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  52.93 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  48.18 
 
 		 579 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  48.28 
 
 		 580 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  48.72 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  48.71 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  44.94 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  43.5 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  43.3 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  42.63 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  41.65 
 
 		 563 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  31.6 
 
 		 538 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  34.15 
 
 		 541 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  33.99 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  30.98 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  27.19 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  29.19 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 		 547 aa  170  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  27.54 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  26.81 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  29.28 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  28.31 
 
 		 593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 		 558 aa  163  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  27.35 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  29.26 
 
 		 543 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  30.62 
 
 		 571 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  27.56 
 
 		 590 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  26.75 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  26.59 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  28.91 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  27.92 
 
 		 519 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  29.95 
 
 		 527 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.68 
 
 		 600 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 		 603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  27.69 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.01 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  29.98 
 
 		 527 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  31.08 
 
 		 572 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.08 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.69 
 
 		 587 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  29.51 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  28.64 
 
 		 580 aa  150  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  28.15 
 
 		 579 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  30.75 
 
 		 526 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  27.98 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  27.7 
 
 		 565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.13 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  29.31 
 
 		 530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  25.45 
 
 		 544 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  25.32 
 
 		 539 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  29.69 
 
 		 571 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  26.05 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  26.67 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  26.14 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.94 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  25.27 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  26.14 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  25.77 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  26.1 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.89 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  25.97 
 
 		 592 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  27.08 
 
 		 583 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  26.07 
 
 		 556 aa  143  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  26.94 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 		 677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  26.71 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  25.19 
 
 		 552 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  28.05 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  27.83 
 
 		 552 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  28.18 
 
 		 558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  28.16 
 
 		 570 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 		 583 aa  140  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  25.47 
 
 		 598 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>