280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2184 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 552 aa  1111    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  47.22 
 
 		 551 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  48.84 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  49.28 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  50 
 
 		 538 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  50 
 
 		 532 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  50.81 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  49.91 
 
 		 532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  48.47 
 
 		 535 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  42.91 
 
 		 538 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  45.18 
 
 		 541 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  46.21 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  44.12 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  45.22 
 
 		 525 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  44.12 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  39.5 
 
 		 551 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  38.72 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  36.49 
 
 		 547 aa  306  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  35.23 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  37.31 
 
 		 525 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  35.27 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  37 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  34.13 
 
 		 522 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  37.45 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.91 
 
 		 523 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 		 542 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  33.15 
 
 		 527 aa  266  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  34.54 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  35.66 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.62 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 		 558 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.62 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 		 553 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.74 
 
 		 539 aa  240  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  32.41 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 		 590 aa  236  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.58 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  35.54 
 
 		 539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.88 
 
 		 587 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.45 
 
 		 537 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.05 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.24 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.35 
 
 		 580 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  36.23 
 
 		 571 aa  230  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  35.92 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.77 
 
 		 567 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.42 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  35.92 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  35.92 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  33.04 
 
 		 504 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  36.83 
 
 		 677 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.99 
 
 		 600 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  36.29 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.27 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  35.66 
 
 		 598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  35.66 
 
 		 598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  35.66 
 
 		 598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  33.14 
 
 		 526 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.66 
 
 		 533 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.13 
 
 		 611 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.13 
 
 		 611 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.83 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 		 593 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  34.52 
 
 		 576 aa  217  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 		 557 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  30.52 
 
 		 592 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  31.64 
 
 		 552 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 		 598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  32.15 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 597 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  28.06 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  34.53 
 
 		 603 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.71 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  35.41 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  34.88 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 592 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  29.67 
 
 		 570 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  29.67 
 
 		 570 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  31.08 
 
 		 595 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  29.67 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  33.26 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  34.38 
 
 		 568 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 		 544 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.09 
 
 		 563 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 		 568 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.69 
 
 		 565 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.48 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 579 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>