260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0353 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 539 aa  1092    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  72.63 
 
 		 539 aa  777    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  72.15 
 
 		 538 aa  790    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  57.01 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  53.28 
 
 		 537 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  39.58 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  39.51 
 
 		 528 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  40.15 
 
 		 527 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  37.1 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  38.33 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  36.74 
 
 		 523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  36.26 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  35.86 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  37.04 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  32.89 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  33.9 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  35.49 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  31.89 
 
 		 600 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.96 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 		 541 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  33.7 
 
 		 552 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.53 
 
 		 587 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 		 538 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.75 
 
 		 580 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 587 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 587 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  37.72 
 
 		 525 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  36.08 
 
 		 519 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 677 aa  243  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.04 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.12 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 587 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.12 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  31.74 
 
 		 552 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 598 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 		 532 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 		 598 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  32.59 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  38.75 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  33.26 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.58 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  32.32 
 
 		 594 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  35.09 
 
 		 569 aa  236  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 		 552 aa  236  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.25 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  36.59 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  36.25 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.03 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  33 
 
 		 568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.63 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  37.66 
 
 		 539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.99 
 
 		 590 aa  233  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 579 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 579 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 538 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  32.93 
 
 		 527 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  33.75 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.54 
 
 		 611 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  34.65 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  37.04 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  33.54 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.04 
 
 		 595 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.11 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 518 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  32.89 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 		 521 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  29.81 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 		 558 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.48 
 
 		 576 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  30.71 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  36.24 
 
 		 533 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  28.55 
 
 		 584 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.48 
 
 		 588 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 		 567 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 592 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>