278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1668 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  56.92 
 
 
574 aa  638    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
567 aa  1137    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0267  flagellar MS-ring protein  61.27 
 
 
568 aa  661    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  84.48 
 
 
565 aa  965    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  56.28 
 
 
561 aa  588  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1645  flagellar MS-ring protein  51.33 
 
 
560 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.01251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0363  flagellar MS-ring protein  51.69 
 
 
560 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0340  flagellar MS-ring protein  51.69 
 
 
560 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  48.08 
 
 
566 aa  514  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  30 
 
 
552 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  37.22 
 
 
562 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.48 
 
 
527 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.41 
 
 
527 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  35.85 
 
 
587 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  37.06 
 
 
587 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  37.06 
 
 
587 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  37.06 
 
 
587 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.7 
 
 
525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.31 
 
 
587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.67 
 
 
539 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.12 
 
 
523 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  36.8 
 
 
587 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.17 
 
 
530 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  28.88 
 
 
528 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  36.8 
 
 
587 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
569 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  35.86 
 
 
677 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  31.77 
 
 
569 aa  226  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.12 
 
 
522 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.57 
 
 
519 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
548 aa  225  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  30.34 
 
 
561 aa  225  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
568 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.65 
 
 
567 aa  223  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  34.04 
 
 
500 aa  223  8e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.5 
 
 
570 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.5 
 
 
570 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  34.31 
 
 
566 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  30.5 
 
 
570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
600 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  35.09 
 
 
593 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  34.22 
 
 
538 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.94 
 
 
565 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  35.98 
 
 
537 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.25 
 
 
579 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.43 
 
 
584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
603 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
576 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
579 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 
580 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  34.94 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  31.92 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  34.94 
 
 
564 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  32.97 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  32.97 
 
 
592 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  32.97 
 
 
592 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31 
 
 
567 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.55 
 
 
539 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 
568 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.74 
 
 
551 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  31.6 
 
 
519 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  33.5 
 
 
552 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  32.96 
 
 
566 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 
536 aa  209  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  31.21 
 
 
588 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  31.62 
 
 
594 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.67 
 
 
590 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.64 
 
 
504 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
611 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
611 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  31.24 
 
 
576 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  31.01 
 
 
598 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
597 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  32.55 
 
 
552 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  32.46 
 
 
547 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 
552 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  32.55 
 
 
552 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  32.55 
 
 
552 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  28.33 
 
 
594 aa  203  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  32.56 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  32.03 
 
 
563 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  32.08 
 
 
552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  28.33 
 
 
594 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  28.88 
 
 
611 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.06 
 
 
551 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  28.05 
 
 
594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 
592 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
563 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>