270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2825 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  80.47 
 
 		 592 aa  953    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  78.19 
 
 		 594 aa  903    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 594 aa  1187    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  77.82 
 
 		 594 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  80.47 
 
 		 592 aa  967    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  82.35 
 
 		 595 aa  968    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  81.48 
 
 		 592 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  80.13 
 
 		 592 aa  949    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  80.5 
 
 		 598 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  80.33 
 
 		 597 aa  952    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  52.05 
 
 		 558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  48.95 
 
 		 556 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  47.31 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  41.21 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  41.03 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  42.3 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  38.54 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  42.33 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  39.55 
 
 		 677 aa  349  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  38.99 
 
 		 552 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  38.96 
 
 		 598 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  38.96 
 
 		 598 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  39.18 
 
 		 600 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  38.53 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  38.17 
 
 		 587 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  39.12 
 
 		 587 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  38.94 
 
 		 587 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  38.35 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  38.35 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  36.7 
 
 		 580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  38.35 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  36.2 
 
 		 590 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.79 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  38.79 
 
 		 593 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  37.99 
 
 		 548 aa  320  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  36.51 
 
 		 584 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  36.4 
 
 		 568 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  36.85 
 
 		 563 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  35.26 
 
 		 567 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  34.9 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  37.04 
 
 		 567 aa  303  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  36.65 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  34.59 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  36.79 
 
 		 586 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  36.38 
 
 		 594 aa  301  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  37.32 
 
 		 570 aa  297  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  37.32 
 
 		 570 aa  297  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  38.63 
 
 		 571 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  35.63 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  37.06 
 
 		 570 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  34.11 
 
 		 564 aa  294  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  36.91 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  35.43 
 
 		 563 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  40.26 
 
 		 552 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  39.83 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  40.04 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  40.04 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  40.04 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  40.04 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  34.18 
 
 		 566 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  33.04 
 
 		 566 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 560 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  32.98 
 
 		 560 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  32.98 
 
 		 560 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  35.84 
 
 		 611 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  35.84 
 
 		 611 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  38.84 
 
 		 560 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  32.82 
 
 		 570 aa  286  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  35.69 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  34.04 
 
 		 560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 		 576 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  35.02 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  35.74 
 
 		 611 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 		 579 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 		 579 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  35.53 
 
 		 565 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  32.74 
 
 		 569 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  37 
 
 		 563 aa  280  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  32.92 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  33.8 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  34.03 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  32.7 
 
 		 566 aa  277  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  33.92 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  36.89 
 
 		 569 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>