269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1016 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
576 aa  1148    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  65.62 
 
 
567 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  56.63 
 
 
588 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  56.45 
 
 
566 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  53.21 
 
 
566 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  55.44 
 
 
564 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  55.44 
 
 
564 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  55.71 
 
 
562 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  48.11 
 
 
567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  46.69 
 
 
568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  45.22 
 
 
600 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  44.33 
 
 
548 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  43.93 
 
 
587 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  45.16 
 
 
593 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  43.53 
 
 
603 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  45.35 
 
 
587 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  45.84 
 
 
611 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  44.56 
 
 
563 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  45.84 
 
 
611 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  45.35 
 
 
587 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  45.03 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  45.03 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  45.03 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  42.04 
 
 
584 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  44.21 
 
 
677 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  47.25 
 
 
560 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  43.23 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  43.23 
 
 
598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  43.23 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
598 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
598 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
598 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
598 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  43.78 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  43.39 
 
 
587 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  41.99 
 
 
586 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  41.07 
 
 
579 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  40.96 
 
 
579 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  41 
 
 
569 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  41.07 
 
 
579 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  39.37 
 
 
552 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  41.07 
 
 
579 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  41.07 
 
 
576 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  39.37 
 
 
552 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  42.59 
 
 
563 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  39.37 
 
 
552 aa  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  39.37 
 
 
552 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  42.72 
 
 
571 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  39.37 
 
 
552 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  39.15 
 
 
552 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  40.74 
 
 
570 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  40.74 
 
 
570 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  40.74 
 
 
570 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  39.93 
 
 
565 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  39.86 
 
 
552 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  38.95 
 
 
568 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  38.25 
 
 
594 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  40.07 
 
 
569 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  40.15 
 
 
576 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  39.15 
 
 
574 aa  346  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  37.88 
 
 
567 aa  340  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  36.39 
 
 
597 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  36.04 
 
 
598 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  35.38 
 
 
592 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.78 
 
 
561 aa  326  9e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  35.79 
 
 
592 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 
592 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  36.57 
 
 
580 aa  316  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 
595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.69 
 
 
556 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  34.59 
 
 
558 aa  307  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  35.09 
 
 
592 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.36 
 
 
594 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.36 
 
 
594 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  36.15 
 
 
552 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  35.15 
 
 
530 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  34.9 
 
 
525 aa  290  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 
594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  33.62 
 
 
590 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  35.67 
 
 
548 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 
568 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 
544 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  36.71 
 
 
519 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 
544 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  36.29 
 
 
595 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  33.15 
 
 
527 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.69 
 
 
523 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.45 
 
 
551 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  32.56 
 
 
527 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.09 
 
 
522 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
528 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  34.21 
 
 
574 aa  254  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  34.21 
 
 
574 aa  254  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 
540 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.38 
 
 
541 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  31.08 
 
 
538 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.65 
 
 
539 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 
551 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.16 
 
 
539 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.77 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>