269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1969 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  100 
 
 
552 aa  1103    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  50.18 
 
 
552 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  46.11 
 
 
567 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  42.21 
 
 
592 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  42.21 
 
 
592 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  42.11 
 
 
556 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  42.81 
 
 
592 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  42.21 
 
 
592 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  45.3 
 
 
580 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  39.93 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  40.92 
 
 
597 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  40.84 
 
 
594 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  41.56 
 
 
595 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  41.12 
 
 
598 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  42.6 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  40.69 
 
 
594 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  42.46 
 
 
567 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  39.09 
 
 
544 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  39.77 
 
 
590 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  42.15 
 
 
594 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  39.09 
 
 
544 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  41.27 
 
 
568 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  40.1 
 
 
548 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  38.82 
 
 
587 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  39.28 
 
 
600 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  38.72 
 
 
677 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  37.73 
 
 
568 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  39.55 
 
 
587 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  39.55 
 
 
587 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  39.55 
 
 
587 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  37.82 
 
 
584 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  38.21 
 
 
598 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  39 
 
 
603 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  38.21 
 
 
598 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  38.21 
 
 
598 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  38.62 
 
 
587 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  36.46 
 
 
567 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  38.68 
 
 
611 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  38.68 
 
 
611 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  38.04 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  38.04 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  38.04 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  38.04 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  38.53 
 
 
587 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  38.53 
 
 
587 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  39.25 
 
 
566 aa  356  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  39.08 
 
 
576 aa  356  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  39.45 
 
 
566 aa  356  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  37.93 
 
 
563 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  38.2 
 
 
593 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  40.25 
 
 
595 aa  349  8e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  40.26 
 
 
560 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  39.51 
 
 
564 aa  346  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  39.51 
 
 
564 aa  346  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  37.81 
 
 
611 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  38.79 
 
 
548 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  39.78 
 
 
588 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  37.73 
 
 
574 aa  343  5.999999999999999e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  37.73 
 
 
574 aa  343  5.999999999999999e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  39.89 
 
 
562 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  39.29 
 
 
552 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  39.29 
 
 
552 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  39.29 
 
 
552 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  39.29 
 
 
552 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  39.29 
 
 
552 aa  340  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  39.12 
 
 
552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  40.08 
 
 
571 aa  336  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  35.88 
 
 
586 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  38.66 
 
 
579 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  38.89 
 
 
576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  38.49 
 
 
579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  38.49 
 
 
579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  38.49 
 
 
579 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  36.96 
 
 
594 aa  319  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  38.03 
 
 
569 aa  317  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  35.5 
 
 
568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  36.16 
 
 
570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  36.16 
 
 
570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  36.36 
 
 
565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  35.61 
 
 
570 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  36.47 
 
 
569 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  39.55 
 
 
568 aa  300  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  38.27 
 
 
576 aa  297  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  35.78 
 
 
566 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  36.33 
 
 
560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 
560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  40.71 
 
 
563 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 
560 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  35.26 
 
 
560 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  35.26 
 
 
560 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  36.45 
 
 
553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 
568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  36.51 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  36.51 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  37.52 
 
 
565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  35.96 
 
 
561 aa  282  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  36.13 
 
 
558 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  37.05 
 
 
578 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.15 
 
 
525 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  35.61 
 
 
566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>