255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2014 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  63.59 
 
 
552 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  64.14 
 
 
579 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  63.59 
 
 
552 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  74.39 
 
 
563 aa  771    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
570 aa  1155    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  64.14 
 
 
576 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  67.54 
 
 
569 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  65.4 
 
 
565 aa  718    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  64.14 
 
 
579 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  66.61 
 
 
574 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  99.82 
 
 
570 aa  1153    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  64.31 
 
 
579 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  63.41 
 
 
552 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
570 aa  1155    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  63.59 
 
 
552 aa  687    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  63.59 
 
 
552 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  65.96 
 
 
568 aa  707    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  63.59 
 
 
552 aa  688    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  64.14 
 
 
579 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  67.08 
 
 
569 aa  718    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  51.77 
 
 
563 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  49.91 
 
 
568 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  47.42 
 
 
587 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  46.83 
 
 
677 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  46.4 
 
 
598 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  45.44 
 
 
600 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  47.7 
 
 
587 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  46.4 
 
 
598 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  46.4 
 
 
598 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  49.28 
 
 
560 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  47.06 
 
 
587 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  46.22 
 
 
598 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  45.09 
 
 
594 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  47.06 
 
 
587 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  46.22 
 
 
598 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  46.22 
 
 
598 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  46.22 
 
 
598 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  45.22 
 
 
603 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  47.34 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  47.34 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  47.34 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  43.18 
 
 
593 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  45.31 
 
 
548 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  44.84 
 
 
584 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  45.2 
 
 
611 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  45.2 
 
 
611 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  46.81 
 
 
576 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  44.19 
 
 
567 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  44.96 
 
 
611 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  44.1 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  42.13 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  43.1 
 
 
564 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  40.97 
 
 
566 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  43.1 
 
 
564 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  47.41 
 
 
562 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  38.45 
 
 
567 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  40 
 
 
576 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  40.25 
 
 
567 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  39.27 
 
 
588 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  43.79 
 
 
571 aa  356  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  35.99 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  36.73 
 
 
597 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  36.58 
 
 
598 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  37.22 
 
 
592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  37.43 
 
 
558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  37.01 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  36.83 
 
 
592 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  35.05 
 
 
595 aa  316  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  36.62 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  36.56 
 
 
552 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.75 
 
 
580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  37.26 
 
 
590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  35.52 
 
 
544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  35.39 
 
 
594 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  35.46 
 
 
594 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  35.86 
 
 
592 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  35.41 
 
 
568 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  36.81 
 
 
594 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 
525 aa  293  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 
556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  33.87 
 
 
527 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  35.94 
 
 
527 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.01 
 
 
530 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.38 
 
 
528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.16 
 
 
595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  35 
 
 
519 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.39 
 
 
523 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.5 
 
 
548 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  30.59 
 
 
522 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 
566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
574 aa  251  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  32.16 
 
 
538 aa  247  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  35.59 
 
 
574 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  35.59 
 
 
574 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  31.82 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.78 
 
 
537 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  33.07 
 
 
566 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  30.26 
 
 
536 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
558 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>