259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5261 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  77.82 
 
 		 568 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 563 aa  1139    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  57.55 
 
 		 560 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  51.83 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  51.61 
 
 		 587 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  52.12 
 
 		 677 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  51.4 
 
 		 603 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  51.85 
 
 		 598 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  51.85 
 
 		 598 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  51.85 
 
 		 598 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  51.5 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  52.14 
 
 		 587 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  51.5 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  52.87 
 
 		 587 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  51.5 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  51.5 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  50.18 
 
 		 593 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  51.96 
 
 		 587 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  51.61 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  51.61 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  51.49 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  51.49 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  51.49 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  51.79 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  50.27 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  48.79 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  50 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  48.61 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  50 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  50 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  48.61 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  48.61 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  49.83 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  48.26 
 
 		 579 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  49.83 
 
 		 552 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  49.47 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  49.83 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  49.91 
 
 		 567 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  48.15 
 
 		 584 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  49.04 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  49.83 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  51.22 
 
 		 611 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  51.22 
 
 		 611 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  48.21 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  47.74 
 
 		 594 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  47.51 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  48.02 
 
 		 586 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  47.96 
 
 		 574 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  47.86 
 
 		 611 aa  475  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  44.9 
 
 		 566 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  45.28 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  43.94 
 
 		 576 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  47.11 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  45.07 
 
 		 562 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  45.47 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  45.47 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  45.81 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  44.22 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  43.39 
 
 		 566 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  41.32 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  39.59 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  40.31 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  38.98 
 
 		 561 aa  359  6e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  38 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  37.89 
 
 		 597 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  38.6 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  37.29 
 
 		 594 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  38.75 
 
 		 592 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  36.78 
 
 		 594 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  36.17 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  37.13 
 
 		 590 aa  333  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  36.33 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  36.33 
 
 		 544 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  38.78 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  36.65 
 
 		 580 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  37.28 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  35.55 
 
 		 556 aa  319  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  39.07 
 
 		 568 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 		 574 aa  296  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 		 574 aa  296  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.48 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.81 
 
 		 595 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.98 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  31.99 
 
 		 527 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.49 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  32.6 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.07 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  30.59 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  32.37 
 
 		 568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 		 566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.65 
 
 		 530 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  32.59 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 		 558 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 		 558 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 		 551 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  32.19 
 
 		 569 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>