279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1158 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 552 aa  1092    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  50.18 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  46 
 
 		 567 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  44.86 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  39.13 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  38.96 
 
 		 592 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  39.13 
 
 		 592 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  39.04 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  38.79 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  38.52 
 
 		 595 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  38.96 
 
 		 592 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  40.18 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  40.18 
 
 		 590 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  37.26 
 
 		 594 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  37.82 
 
 		 556 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  36.38 
 
 		 544 aa  346  8e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  37.43 
 
 		 594 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  36.38 
 
 		 544 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  38.05 
 
 		 594 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  38.24 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  36.71 
 
 		 561 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  39.26 
 
 		 568 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  39.73 
 
 		 548 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  37.11 
 
 		 587 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  37.97 
 
 		 567 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  36.41 
 
 		 568 aa  316  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  35.86 
 
 		 593 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  36.59 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  37.59 
 
 		 563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  35.99 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  36.79 
 
 		 600 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  35.77 
 
 		 603 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  35.82 
 
 		 584 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  35.99 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  35.99 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  35.99 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  35.8 
 
 		 552 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  35.99 
 
 		 552 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  38.02 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  38.02 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  36.95 
 
 		 677 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  36.54 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  37.94 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  36.54 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  37.76 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  39.58 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  37.76 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  37.76 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  37.76 
 
 		 576 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  36.76 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  36.76 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  36.76 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  37.81 
 
 		 560 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  34.6 
 
 		 560 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  34.6 
 
 		 560 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  35.94 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  35.94 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  35.74 
 
 		 587 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  35.74 
 
 		 587 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  35.74 
 
 		 587 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  35.56 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  35.94 
 
 		 570 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  35.25 
 
 		 527 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  36.41 
 
 		 565 aa  294  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  35.1 
 
 		 530 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  34.67 
 
 		 528 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  35.43 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  35.43 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  35.15 
 
 		 568 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  36.5 
 
 		 587 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  34.25 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  34.21 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  36.31 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  35.26 
 
 		 561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  35.26 
 
 		 561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  35.56 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  36.48 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  36.48 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  34.54 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  35.62 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  35.66 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  36.38 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  37.19 
 
 		 563 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  36.82 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  33.82 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  34.48 
 
 		 586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  35.71 
 
 		 569 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  33.63 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 		 568 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  35.84 
 
 		 562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.05 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>