286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3304 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  67.99 
 
 
527 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  65.28 
 
 
522 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  68.43 
 
 
527 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
530 aa  1077    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  66.79 
 
 
525 aa  724    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  64.52 
 
 
523 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  69.43 
 
 
528 aa  764    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  43.07 
 
 
519 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  37.1 
 
 
539 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  42.22 
 
 
538 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  38.25 
 
 
537 aa  316  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  41.61 
 
 
539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  34.9 
 
 
504 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 
541 aa  296  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 
540 aa  292  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.4 
 
 
551 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  35.22 
 
 
552 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  36.21 
 
 
532 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  38.86 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  34.43 
 
 
568 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  35.14 
 
 
552 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 
538 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  34.7 
 
 
593 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.93 
 
 
587 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  35.15 
 
 
576 aa  280  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  34.96 
 
 
562 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  35.71 
 
 
551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.55 
 
 
587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.06 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  38.07 
 
 
525 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  39.59 
 
 
547 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  36.11 
 
 
560 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.42 
 
 
603 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  37.65 
 
 
539 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 
512 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.25 
 
 
677 aa  270  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.08 
 
 
587 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  34.98 
 
 
532 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  36.88 
 
 
541 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
598 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
598 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
598 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 
587 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 
587 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 
587 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.76 
 
 
552 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
552 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
552 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.76 
 
 
552 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  33.81 
 
 
588 aa  266  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 
552 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  32.37 
 
 
540 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  32.37 
 
 
540 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
570 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.98 
 
 
571 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.82 
 
 
552 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 
600 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  32.77 
 
 
576 aa  264  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 
598 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 
598 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 
569 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 
598 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.62 
 
 
598 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.94 
 
 
567 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  35.57 
 
 
539 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 
563 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  33.76 
 
 
567 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.19 
 
 
594 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
535 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  33.27 
 
 
566 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.42 
 
 
565 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  34.72 
 
 
611 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  34.72 
 
 
611 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.46 
 
 
590 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 
548 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
576 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
579 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
579 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
579 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.54 
 
 
579 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  35.37 
 
 
569 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 
524 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  37.31 
 
 
536 aa  254  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  32.16 
 
 
611 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  32.14 
 
 
566 aa  253  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.84 
 
 
561 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  31.33 
 
 
529 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 
595 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.41 
 
 
580 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  32.3 
 
 
524 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  32.92 
 
 
584 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  37.65 
 
 
518 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 
568 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 
565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  35.19 
 
 
519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  34.19 
 
 
568 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>