283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4213 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  71.35 
 
 
527 aa  765    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  75.86 
 
 
523 aa  779    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  70.27 
 
 
527 aa  760    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  66.79 
 
 
530 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  73.76 
 
 
522 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
525 aa  1069    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  65.33 
 
 
528 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  46.2 
 
 
519 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  39.58 
 
 
539 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  42.5 
 
 
538 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  37.64 
 
 
539 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  40.9 
 
 
537 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  38.85 
 
 
533 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  35.63 
 
 
587 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  36.29 
 
 
504 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.73 
 
 
587 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  32.72 
 
 
540 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  36.77 
 
 
551 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  34.87 
 
 
587 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.52 
 
 
587 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 
541 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  34.57 
 
 
569 aa  286  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 
600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  34.96 
 
 
587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 
570 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 
570 aa  283  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  33.89 
 
 
552 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  33.4 
 
 
576 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 
593 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 
560 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  33.52 
 
 
567 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
603 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  38.6 
 
 
547 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  37.31 
 
 
552 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  37.42 
 
 
552 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 
570 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  38.19 
 
 
519 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 
552 aa  277  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  37.2 
 
 
552 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 
552 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 
552 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  37.2 
 
 
552 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.74 
 
 
567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  34.72 
 
 
576 aa  274  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.76 
 
 
567 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 
579 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  33.33 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
579 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
579 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
576 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
579 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
677 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 
598 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 
598 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  34.45 
 
 
588 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 
598 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.69 
 
 
594 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
551 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 
562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.94 
 
 
538 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 
532 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  38.32 
 
 
536 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.41 
 
 
565 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 
525 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
598 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
598 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
598 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
538 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 
539 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
598 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  34.17 
 
 
566 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  32.11 
 
 
568 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 
548 aa  262  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 
611 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 
611 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.9 
 
 
580 aa  259  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 
512 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  32.78 
 
 
535 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  39.01 
 
 
533 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 
569 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.21 
 
 
571 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 
563 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.24 
 
 
568 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  39.86 
 
 
533 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 
595 aa  257  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.49 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.94 
 
 
611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.33 
 
 
548 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  35.93 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  32.96 
 
 
529 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.26 
 
 
590 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  34.88 
 
 
584 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  36.49 
 
 
540 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  36.49 
 
 
540 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
564 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
564 aa  251  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 
539 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
574 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>