258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3047 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  63.42 
 
 		 563 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 568 aa  1154    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  73.06 
 
 		 564 aa  840    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  54.93 
 
 		 568 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  54.56 
 
 		 560 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  54.38 
 
 		 560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  54.38 
 
 		 560 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  53.89 
 
 		 566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  54.38 
 
 		 560 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  54.8 
 
 		 560 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  55.23 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  55.34 
 
 		 561 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  55.34 
 
 		 561 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  55.34 
 
 		 561 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  55.91 
 
 		 566 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  55.89 
 
 		 565 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  55.68 
 
 		 565 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  55.44 
 
 		 569 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  54.63 
 
 		 558 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  48.4 
 
 		 580 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  47.94 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  47.9 
 
 		 580 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.22 
 
 		 594 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.66 
 
 		 594 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.22 
 
 		 561 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  35.53 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  35.64 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.22 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.22 
 
 		 592 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  36.48 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  35.5 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 		 544 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  33.11 
 
 		 592 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 		 544 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.97 
 
 		 594 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.37 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  33.93 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  32.25 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  35.15 
 
 		 552 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.21 
 
 		 590 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 		 548 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.95 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.62 
 
 		 594 aa  246  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.2 
 
 		 600 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.83 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 		 603 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.08 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.69 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 576 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 579 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.96 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 579 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  34.63 
 
 		 552 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  34.63 
 
 		 552 aa  232  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  34.63 
 
 		 552 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.36 
 
 		 593 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.78 
 
 		 527 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  34.17 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.8 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 		 569 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.29 
 
 		 567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.86 
 
 		 560 aa  226  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  32.69 
 
 		 584 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.23 
 
 		 677 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.17 
 
 		 598 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 		 570 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  31.32 
 
 		 567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  27.5 
 
 		 569 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.32 
 
 		 611 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.32 
 
 		 611 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  30.33 
 
 		 568 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  29.85 
 
 		 527 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.2 
 
 		 565 aa  216  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.89 
 
 		 563 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  28.13 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.51 
 
 		 611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>