259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2127 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  86.13 
 
 
552 aa  956    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  99.83 
 
 
579 aa  1179    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  85.77 
 
 
552 aa  953    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  64.13 
 
 
570 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  85.95 
 
 
552 aa  951    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  85.95 
 
 
552 aa  953    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  64.31 
 
 
570 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  99.83 
 
 
579 aa  1180    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  83.01 
 
 
565 aa  946    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
579 aa  1182    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  63.04 
 
 
569 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  86.13 
 
 
552 aa  956    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  86.13 
 
 
552 aa  956    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  61.94 
 
 
574 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
579 aa  1182    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  64.13 
 
 
570 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  62.59 
 
 
568 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  63.27 
 
 
569 aa  651    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  99.48 
 
 
576 aa  1141    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  66.67 
 
 
563 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  46.07 
 
 
587 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  48.26 
 
 
563 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  47.02 
 
 
587 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  47.02 
 
 
587 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  47.02 
 
 
587 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  48.13 
 
 
568 aa  485  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  45.6 
 
 
603 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  46.47 
 
 
587 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  46.38 
 
 
587 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  45.39 
 
 
600 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  45.8 
 
 
677 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  46.82 
 
 
587 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  45.74 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  45.74 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  44.05 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  45.74 
 
 
598 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  45.57 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  45.57 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  45.57 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  45.57 
 
 
598 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  46.75 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  45.37 
 
 
584 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  46.56 
 
 
567 aa  435  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  43.39 
 
 
594 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  45.91 
 
 
611 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  45.91 
 
 
611 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  43.94 
 
 
548 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  44.97 
 
 
586 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  44.7 
 
 
611 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  44.42 
 
 
576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  41.4 
 
 
566 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  41.94 
 
 
562 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  41.02 
 
 
564 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  41.02 
 
 
564 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  40.36 
 
 
576 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  40.11 
 
 
566 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  39.1 
 
 
567 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  38.15 
 
 
588 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  39.96 
 
 
567 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  44.03 
 
 
571 aa  352  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  37.74 
 
 
561 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  38.89 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  36.04 
 
 
590 aa  319  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  42.48 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  36.7 
 
 
592 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  35.05 
 
 
597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  35.05 
 
 
598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  36.35 
 
 
592 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  36.38 
 
 
544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  36.35 
 
 
592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  37.1 
 
 
558 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  36.2 
 
 
544 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  35.87 
 
 
552 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  35.53 
 
 
595 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  36.44 
 
 
556 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.76 
 
 
594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  34.76 
 
 
592 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.32 
 
 
594 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.94 
 
 
525 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  36.84 
 
 
568 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  35.24 
 
 
594 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.15 
 
 
523 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 
548 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  33.09 
 
 
595 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.53 
 
 
522 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.89 
 
 
519 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.56 
 
 
527 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  35.27 
 
 
527 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 
574 aa  264  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 
574 aa  264  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  32.69 
 
 
566 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.94 
 
 
530 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  30.07 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.91 
 
 
528 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  33.9 
 
 
538 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  37.72 
 
 
537 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.06 
 
 
551 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.67 
 
 
504 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 
561 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>