269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3807 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  99.82 
 
 
564 aa  1112    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  61.99 
 
 
588 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  65.28 
 
 
566 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  75.31 
 
 
566 aa  809    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
564 aa  1116    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  67.58 
 
 
562 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  55.65 
 
 
576 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  55.14 
 
 
567 aa  557  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  47.88 
 
 
567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  46.1 
 
 
568 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  44.42 
 
 
584 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  46.9 
 
 
548 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  44.99 
 
 
677 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  43.2 
 
 
603 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  43.58 
 
 
611 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  43.67 
 
 
598 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  43.67 
 
 
598 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  43.67 
 
 
598 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  43.74 
 
 
600 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  43.58 
 
 
611 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  43.48 
 
 
598 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  43.48 
 
 
598 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  43.33 
 
 
587 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  45.44 
 
 
563 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  43.48 
 
 
598 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  43.48 
 
 
598 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  43.37 
 
 
587 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  42.51 
 
 
587 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  43.42 
 
 
587 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  42.51 
 
 
587 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  43.42 
 
 
587 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  44.41 
 
 
560 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  43.42 
 
 
587 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  43.72 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  43.45 
 
 
569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  40.93 
 
 
593 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  41.43 
 
 
552 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  41.43 
 
 
552 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  41.43 
 
 
552 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  41.43 
 
 
552 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  41.43 
 
 
552 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  41.25 
 
 
552 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  42.35 
 
 
570 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  42.35 
 
 
570 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  42.5 
 
 
611 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  42.35 
 
 
570 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  39.79 
 
 
579 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 
579 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 
579 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  43.54 
 
 
563 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  39.97 
 
 
579 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  40.83 
 
 
576 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  42.38 
 
 
568 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  39.02 
 
 
565 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  41.46 
 
 
569 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  46.41 
 
 
571 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  40.07 
 
 
552 aa  359  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  39.63 
 
 
574 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  38.38 
 
 
594 aa  349  8e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  39.7 
 
 
576 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  40.17 
 
 
567 aa  336  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  34.55 
 
 
561 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.64 
 
 
580 aa  319  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  34.92 
 
 
558 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  36.82 
 
 
552 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.72 
 
 
592 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
544 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  35.89 
 
 
556 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.28 
 
 
598 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 
597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 
544 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.83 
 
 
592 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.83 
 
 
592 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  32.26 
 
 
590 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  36.62 
 
 
548 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  32.6 
 
 
595 aa  276  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  34.81 
 
 
594 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  36.19 
 
 
574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  36.19 
 
 
574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  32.61 
 
 
592 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  34.42 
 
 
525 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.93 
 
 
595 aa  259  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.14 
 
 
527 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
594 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
568 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  34.73 
 
 
523 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  32.64 
 
 
594 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  33.04 
 
 
528 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  37.63 
 
 
527 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.45 
 
 
519 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  34.73 
 
 
530 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 
522 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.4 
 
 
551 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.2 
 
 
537 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  35.56 
 
 
566 aa  228  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  34.65 
 
 
565 aa  227  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.91 
 
 
539 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  30.5 
 
 
536 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.11 
 
 
538 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
578 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>