278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
519 aa  1057    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  35.35 
 
 
525 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  37.7 
 
 
524 aa  289  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  35.26 
 
 
523 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  34.81 
 
 
519 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.93 
 
 
527 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  34.31 
 
 
527 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.39 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  32.38 
 
 
533 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  38.96 
 
 
524 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  34.8 
 
 
540 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  33.59 
 
 
533 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.26 
 
 
530 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 
512 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  33.39 
 
 
538 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  32.9 
 
 
539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.2 
 
 
566 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 
521 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  30.89 
 
 
531 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.74 
 
 
519 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  33.15 
 
 
503 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.51 
 
 
528 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  29.82 
 
 
537 aa  249  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  34.11 
 
 
500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  32.79 
 
 
527 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.17 
 
 
565 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  33.99 
 
 
537 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
567 aa  238  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 
570 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 
570 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  35.14 
 
 
539 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.89 
 
 
570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  31.42 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.94 
 
 
536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  28.6 
 
 
537 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
518 aa  233  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  28.55 
 
 
563 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  33.8 
 
 
547 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 
574 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.64 
 
 
552 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 
552 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 
552 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 
552 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
552 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  28.75 
 
 
568 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  33.87 
 
 
552 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.3 
 
 
587 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.1 
 
 
504 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.67 
 
 
562 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 
569 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
576 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  28.83 
 
 
569 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
579 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
579 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
579 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  29.39 
 
 
566 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
579 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0267  flagellar MS-ring protein  34.03 
 
 
568 aa  223  9e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  32.48 
 
 
565 aa  223  9e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  31.71 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.85 
 
 
611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  34.11 
 
 
571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  29.57 
 
 
561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  35.84 
 
 
677 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  32.54 
 
 
594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
587 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
587 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  32.48 
 
 
611 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
587 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
567 aa  221  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  32.48 
 
 
611 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.12 
 
 
600 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  30.35 
 
 
535 aa  220  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
598 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
587 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  35.04 
 
 
587 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  35.84 
 
 
587 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  31.7 
 
 
516 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.66 
 
 
541 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  34.81 
 
 
603 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 
568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 
548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.68 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  31.59 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.93 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  29.61 
 
 
559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
584 aa  213  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  30.32 
 
 
539 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
561 aa  212  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  29.69 
 
 
552 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  32.48 
 
 
563 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.98 
 
 
580 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  27.37 
 
 
590 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  29.13 
 
 
551 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>