280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1765 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
518 aa  1032    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  44.04 
 
 
512 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  39.41 
 
 
521 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  47.42 
 
 
498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  43.9 
 
 
524 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  34.83 
 
 
525 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.66 
 
 
527 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  34.14 
 
 
530 aa  263  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.46 
 
 
523 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  33.46 
 
 
527 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  37.35 
 
 
537 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.4 
 
 
522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 
519 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.84 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  35.48 
 
 
524 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  35.2 
 
 
527 aa  240  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.35 
 
 
539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  32.81 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
533 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  34.31 
 
 
538 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.74 
 
 
539 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.83 
 
 
537 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  33.14 
 
 
519 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  33.7 
 
 
532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  35.07 
 
 
551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.06 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 
587 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  34.93 
 
 
552 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  35.16 
 
 
552 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  35.16 
 
 
552 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 
587 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  35.16 
 
 
552 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 
532 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  35.16 
 
 
552 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  33.42 
 
 
547 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.55 
 
 
587 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  34.93 
 
 
552 aa  217  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.31 
 
 
587 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 
566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  34.62 
 
 
579 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
500 aa  213  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  34.99 
 
 
548 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  34.92 
 
 
504 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  34.4 
 
 
579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  34.4 
 
 
576 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  34.4 
 
 
579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  28.04 
 
 
535 aa  211  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  34.4 
 
 
579 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.25 
 
 
600 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  28.8 
 
 
533 aa  209  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 
503 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  32.28 
 
 
537 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  31.13 
 
 
516 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  31.24 
 
 
531 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  35.05 
 
 
552 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  36.18 
 
 
677 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  35.53 
 
 
561 aa  206  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  35.23 
 
 
598 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  35.23 
 
 
598 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  35.23 
 
 
598 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  29.32 
 
 
559 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 
569 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  32.67 
 
 
611 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  32.67 
 
 
611 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  32.49 
 
 
565 aa  204  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.62 
 
 
567 aa  203  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  28.65 
 
 
603 aa  203  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
567 aa  203  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  31.19 
 
 
530 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  34.97 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  34.97 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  34.97 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  34.97 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.92 
 
 
593 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.93 
 
 
611 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  33.52 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.75 
 
 
580 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  30.74 
 
 
489 aa  200  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  32.69 
 
 
568 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  33.53 
 
 
562 aa  199  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  31 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  29.83 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  31.09 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 
576 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  33.91 
 
 
552 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  30.55 
 
 
567 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  32.37 
 
 
574 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
570 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
570 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  29.13 
 
 
532 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  29.61 
 
 
588 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  37.19 
 
 
571 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  33.99 
 
 
565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
570 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
538 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.39 
 
 
541 aa  189  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 
584 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>