260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0727 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 532 aa  1058    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  98.31 
 
 		 532 aa  1042    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  47.22 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  50.51 
 
 		 489 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  41.51 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  30.73 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 518 aa  200  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  29.68 
 
 		 519 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  30.59 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  28.13 
 
 		 537 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  29.67 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  26.72 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  32.98 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  28.6 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.93 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  29.98 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.02 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  27.34 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  36.09 
 
 		 677 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  29.06 
 
 		 533 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  31.4 
 
 		 600 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  34.44 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 598 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.4 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.83 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  27.39 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  26.13 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 		 566 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  27.93 
 
 		 530 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  34.72 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  28.76 
 
 		 579 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 		 587 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  28.24 
 
 		 576 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  27.49 
 
 		 548 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  28.24 
 
 		 579 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  28.24 
 
 		 579 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 552 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 		 587 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  28.24 
 
 		 579 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.9 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  33.24 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  28.63 
 
 		 567 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  32.98 
 
 		 538 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  27.15 
 
 		 500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.59 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 		 566 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.63 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.51 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.51 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  28.94 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  32.65 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  31.67 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  31.87 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  36.56 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  27.49 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 569 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.45 
 
 		 571 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  38.08 
 
 		 611 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  38.08 
 
 		 611 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.41 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  27.12 
 
 		 519 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  28.76 
 
 		 565 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.85 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.65 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.28 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  27.31 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  27.17 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  29.78 
 
 		 569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.65 
 
 		 563 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  25.91 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  31.44 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  28.35 
 
 		 597 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  27.4 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 		 574 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  36.07 
 
 		 611 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 583 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  28.3 
 
 		 598 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  26.28 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  28.77 
 
 		 569 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  27.74 
 
 		 590 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  29.1 
 
 		 586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>