253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0834 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
535 aa  1070    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  59.59 
 
 
489 aa  578  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  49.25 
 
 
532 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  49.04 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  34.14 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  30.11 
 
 
503 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.52 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  28.17 
 
 
518 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  30.46 
 
 
524 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  27.54 
 
 
600 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.28 
 
 
587 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  26.48 
 
 
603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  28.01 
 
 
537 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  33.7 
 
 
504 aa  181  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  27.41 
 
 
593 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.49 
 
 
571 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  29.19 
 
 
533 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  27.42 
 
 
521 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  26.77 
 
 
579 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  26.97 
 
 
568 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  26.77 
 
 
579 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  26.77 
 
 
579 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  26.77 
 
 
576 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  26.77 
 
 
579 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  28.02 
 
 
587 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 
587 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 
587 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 
587 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  28.02 
 
 
587 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  28.19 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  27.31 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  26.82 
 
 
522 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  27.06 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  28.25 
 
 
598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  28.25 
 
 
598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 
598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 
552 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  28.67 
 
 
552 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  28.34 
 
 
552 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  28.52 
 
 
552 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 
552 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  26.49 
 
 
523 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 
552 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  28.06 
 
 
598 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  28.06 
 
 
598 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  28.06 
 
 
598 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  28.06 
 
 
598 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  26.99 
 
 
527 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  26.54 
 
 
569 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  26.22 
 
 
519 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  26.47 
 
 
565 aa  170  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  32 
 
 
566 aa  169  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  32.23 
 
 
498 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  27.68 
 
 
533 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  27.26 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  26.58 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  25.51 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  25.51 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  25.51 
 
 
570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  27.63 
 
 
584 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  28.99 
 
 
548 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  26.67 
 
 
512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
524 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  30.41 
 
 
538 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  29.64 
 
 
540 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  31.93 
 
 
536 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  26.68 
 
 
530 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  30.77 
 
 
530 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  26 
 
 
567 aa  161  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.81 
 
 
537 aa  161  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  23.77 
 
 
539 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.29 
 
 
567 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  25.74 
 
 
528 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  24.6 
 
 
566 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  34.28 
 
 
611 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  34.28 
 
 
611 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  27.34 
 
 
558 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.12 
 
 
561 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  26.21 
 
 
588 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  28.67 
 
 
580 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  33.45 
 
 
611 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0363  flagellar MS-ring protein  29.12 
 
 
560 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  28.33 
 
 
594 aa  156  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  25.29 
 
 
566 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 
558 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  25.38 
 
 
531 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0340  flagellar MS-ring protein  29.12 
 
 
560 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  26.33 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1645  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 
560 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.01251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.14 
 
 
568 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  34.63 
 
 
569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  28.38 
 
 
527 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  26.56 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  33.85 
 
 
574 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  32.41 
 
 
551 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  28.9 
 
 
563 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  25.09 
 
 
500 aa  151  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.78 
 
 
590 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  26.92 
 
 
576 aa  150  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>