263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1373 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
516 aa  1040    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  41.58 
 
 
532 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  41.36 
 
 
532 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  34.21 
 
 
535 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  38.01 
 
 
489 aa  293  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.62 
 
 
519 aa  207  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  29.25 
 
 
503 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.22 
 
 
552 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  29.22 
 
 
519 aa  180  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  26.44 
 
 
570 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  26.44 
 
 
570 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  29.04 
 
 
552 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  29.04 
 
 
552 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 
518 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  29.04 
 
 
552 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  33.74 
 
 
524 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 
533 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  32.08 
 
 
498 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  29.04 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  26.48 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  26.44 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  28.44 
 
 
521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  29.69 
 
 
500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  28.86 
 
 
552 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.43 
 
 
519 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  27.62 
 
 
569 aa  170  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  28 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  28 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  28 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  28 
 
 
576 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  28 
 
 
579 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  27.4 
 
 
527 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  28.68 
 
 
530 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  25.87 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  29.92 
 
 
540 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  32.54 
 
 
524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
564 aa  163  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
564 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  27.02 
 
 
611 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  27.02 
 
 
611 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
504 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 
677 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.59 
 
 
587 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  27.95 
 
 
600 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  26.97 
 
 
562 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  27.89 
 
 
565 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 
566 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  25.92 
 
 
523 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  27.18 
 
 
583 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.96 
 
 
603 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.14 
 
 
593 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.06 
 
 
556 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.29 
 
 
587 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  35.74 
 
 
568 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  27.13 
 
 
527 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 
570 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 
587 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  28.5 
 
 
565 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 
598 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  25.44 
 
 
522 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.99 
 
 
587 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  31.23 
 
 
536 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  25.79 
 
 
558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  29.86 
 
 
560 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 
587 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  26.39 
 
 
567 aa  156  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  26.47 
 
 
537 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  32.04 
 
 
567 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  26.61 
 
 
538 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  28.9 
 
 
512 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  26.9 
 
 
566 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  29.84 
 
 
530 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  27.95 
 
 
611 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  27.03 
 
 
568 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.27 
 
 
548 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  25.93 
 
 
576 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
598 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
598 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
598 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 
598 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  26.92 
 
 
569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  28.9 
 
 
565 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 
584 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  26.12 
 
 
540 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  30.12 
 
 
558 aa  150  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  34.71 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  28.61 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  25.98 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  28.11 
 
 
537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  26.88 
 
 
527 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  24.78 
 
 
590 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  34.63 
 
 
569 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  26.38 
 
 
532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  26.04 
 
 
541 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  25.86 
 
 
552 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  26.56 
 
 
535 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>