264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0849 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
540 aa  1090    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  34.67 
 
 
519 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  31.31 
 
 
525 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  37.4 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  31.48 
 
 
519 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.31 
 
 
527 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 
565 aa  219  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  30.58 
 
 
523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  31.4 
 
 
537 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  29.96 
 
 
530 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  32.42 
 
 
504 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 
522 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  31.24 
 
 
527 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.5 
 
 
519 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  34.5 
 
 
528 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.88 
 
 
593 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.06 
 
 
533 aa  206  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  29.85 
 
 
533 aa  202  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  29.98 
 
 
564 aa  200  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  29.98 
 
 
564 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.96 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  33.6 
 
 
566 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.57 
 
 
580 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  29.37 
 
 
503 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.5 
 
 
569 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.81 
 
 
571 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
587 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 
579 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 
576 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 
579 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 
579 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 
587 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  29.53 
 
 
677 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.31 
 
 
567 aa  193  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  29.43 
 
 
579 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  31.68 
 
 
574 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 
587 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.96 
 
 
539 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 
566 aa  190  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 
587 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 
587 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 
587 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 
587 aa  190  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.26 
 
 
603 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 
576 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 
567 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  31.32 
 
 
562 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  33.25 
 
 
567 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.94 
 
 
536 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 
600 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  28.6 
 
 
565 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.26 
 
 
537 aa  187  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.57 
 
 
539 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1645  flagellar MS-ring protein  30.72 
 
 
560 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.01251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0363  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 
560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  32.01 
 
 
561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0340  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  28.44 
 
 
588 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  32.94 
 
 
524 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 
548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  30.94 
 
 
556 aa  183  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  27.24 
 
 
531 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 
512 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0267  flagellar MS-ring protein  32.64 
 
 
568 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 
513 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  27.68 
 
 
567 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  28.94 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 
538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
552 aa  181  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
552 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  38.97 
 
 
521 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  28.75 
 
 
552 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.39 
 
 
552 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  30.07 
 
 
559 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  26.48 
 
 
568 aa  177  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
518 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  28.68 
 
 
561 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.3 
 
 
560 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.48 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  26.9 
 
 
576 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  29.17 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  32.35 
 
 
611 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  32.35 
 
 
611 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  33.16 
 
 
551 aa  173  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  29.87 
 
 
535 aa  173  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  29.92 
 
 
516 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  32.21 
 
 
532 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  32.15 
 
 
530 aa  170  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  30 
 
 
563 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  26.06 
 
 
570 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  32.04 
 
 
532 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>