266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0790 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 533 aa  1062    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  38.85 
 
 		 525 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  38.36 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  38.33 
 
 		 522 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  38.61 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  36.49 
 
 		 519 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  37.84 
 
 		 539 aa  276  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  37.04 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  39.36 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  35.89 
 
 		 538 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  37.77 
 
 		 527 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 		 551 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  36.26 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  35 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  31.04 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  31.9 
 
 		 519 aa  253  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  35.64 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 		 551 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34 
 
 		 567 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  37.25 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.57 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 		 576 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.8 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  35.47 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  33.79 
 
 		 530 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.79 
 
 		 593 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.08 
 
 		 565 aa  228  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  34 
 
 		 560 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  29.66 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.35 
 
 		 603 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34 
 
 		 563 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.83 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.01 
 
 		 561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 		 566 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 548 aa  216  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  33.18 
 
 		 531 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  28.47 
 
 		 533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 540 aa  213  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  31.91 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  30.86 
 
 		 569 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  32.81 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.42 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  33.95 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.92 
 
 		 595 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.99 
 
 		 677 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  33.49 
 
 		 558 aa  210  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.22 
 
 		 571 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  34.26 
 
 		 519 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  31.19 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.1 
 
 		 587 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  32.23 
 
 		 598 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  32.23 
 
 		 598 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.23 
 
 		 598 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  32.13 
 
 		 567 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 		 537 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  30.16 
 
 		 539 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  33.25 
 
 		 564 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  34.67 
 
 		 562 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.08 
 
 		 587 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  33.25 
 
 		 564 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  31.86 
 
 		 567 aa  204  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  31.37 
 
 		 559 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.97 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.97 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.97 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.97 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  28.1 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  31.3 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  30.65 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2271  flagellar M-ring protein FliF  32.82 
 
 		 502 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.08 
 
 		 580 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.34 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  31.62 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  30.86 
 
 		 552 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  33.25 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  28.44 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  32.92 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>