279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0424 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
530 aa  1061    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  37.29 
 
 
519 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.53 
 
 
525 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.08 
 
 
523 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.27 
 
 
522 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  37.19 
 
 
528 aa  253  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  34.57 
 
 
527 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  35.8 
 
 
538 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  37.34 
 
 
504 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.47 
 
 
587 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  33.18 
 
 
552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  34.02 
 
 
552 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 
552 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 
552 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  33.47 
 
 
533 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  34.65 
 
 
539 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
552 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.94 
 
 
537 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  34.02 
 
 
552 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  34.62 
 
 
530 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  33.81 
 
 
600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
587 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  33.78 
 
 
587 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
579 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
579 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
579 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
579 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 
547 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.68 
 
 
576 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  34.15 
 
 
527 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.99 
 
 
539 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  34.17 
 
 
677 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  32.32 
 
 
598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 
587 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 
587 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  35.14 
 
 
587 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  35.71 
 
 
551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  31.33 
 
 
568 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.76 
 
 
552 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 
598 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  29.28 
 
 
565 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 
603 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  34.01 
 
 
587 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  32.93 
 
 
593 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  35.84 
 
 
541 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 
563 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  29.76 
 
 
569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  37.03 
 
 
538 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  37.84 
 
 
525 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  34.05 
 
 
560 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  34.87 
 
 
540 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  37.44 
 
 
539 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 
567 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 
563 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  34.12 
 
 
580 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.46 
 
 
551 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  37.03 
 
 
540 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  37.03 
 
 
540 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.58 
 
 
519 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  36.01 
 
 
541 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  33.51 
 
 
566 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  36.68 
 
 
538 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  31.39 
 
 
567 aa  206  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  34.41 
 
 
535 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
584 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  33.2 
 
 
532 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  28.97 
 
 
570 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  28.97 
 
 
570 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.93 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  28.97 
 
 
570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  32.66 
 
 
536 aa  201  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  35.81 
 
 
532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  29.85 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  32.14 
 
 
566 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.89 
 
 
592 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  32.22 
 
 
564 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  32.22 
 
 
564 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.91 
 
 
562 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.36 
 
 
590 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
592 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  34.74 
 
 
524 aa  193  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
592 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  32.08 
 
 
567 aa  194  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  31 
 
 
566 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.88 
 
 
611 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.88 
 
 
611 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.12 
 
 
571 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
558 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  28.32 
 
 
588 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  36 
 
 
574 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  32.19 
 
 
594 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  32.76 
 
 
576 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  31.19 
 
 
561 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 
518 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>