263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1358 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0363  flagellar MS-ring protein  64.41 
 
 		 560 aa  717    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1645  flagellar MS-ring protein  63.17 
 
 		 560 aa  720    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.01251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 561 aa  1128    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0340  flagellar MS-ring protein  64.23 
 
 		 560 aa  715    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  56.94 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0267  flagellar MS-ring protein  54.95 
 
 		 568 aa  596  1e-169  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  56.28 
 
 		 567 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  53.09 
 
 		 574 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  46.14 
 
 		 566 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  36.63 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  36.77 
 
 		 527 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  35.57 
 
 		 523 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.4 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  34.34 
 
 		 569 aa  240  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  33.4 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  37.05 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  34.65 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.47 
 
 		 536 aa  229  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.81 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  36.7 
 
 		 593 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  37.89 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  37.89 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  37.89 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  32.42 
 
 		 569 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  29.6 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  29.6 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.28 
 
 		 561 aa  224  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  37.08 
 
 		 677 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  36.12 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  38.14 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  29.6 
 
 		 570 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.35 
 
 		 594 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  36.57 
 
 		 598 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 		 584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.31 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  37.89 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  37.11 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  36.86 
 
 		 603 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  37.76 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.87 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  34.29 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  34.3 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  35.71 
 
 		 537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  35.53 
 
 		 562 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.8 
 
 		 567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.9 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  28.4 
 
 		 568 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.55 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  33.18 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.29 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 		 598 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 597 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  33.11 
 
 		 567 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.4 
 
 		 571 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 		 592 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  32.01 
 
 		 576 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.06 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 		 592 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  33.73 
 
 		 568 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 		 592 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.08 
 
 		 544 aa  204  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.92 
 
 		 541 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  33.26 
 
 		 567 aa  203  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.08 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.92 
 
 		 590 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.26 
 
 		 552 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  33.5 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.58 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  35.14 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  33.1 
 
 		 525 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.8 
 
 		 539 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  32.48 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  32.11 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  30.32 
 
 		 595 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  33.09 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  32.62 
 
 		 538 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  31.95 
 
 		 552 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  34.67 
 
 		 560 aa  194  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>