270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0691 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  90.57 
 
 
541 aa  991    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  79.74 
 
 
538 aa  826    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  78.64 
 
 
532 aa  812    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  81.43 
 
 
539 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  78.82 
 
 
532 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
540 aa  1088    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  77.59 
 
 
535 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  49.54 
 
 
538 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  51.24 
 
 
525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  50.55 
 
 
539 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  50.19 
 
 
541 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  49.28 
 
 
552 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  50 
 
 
540 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  50.19 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  41.12 
 
 
551 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  36.11 
 
 
551 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  36.82 
 
 
547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  35.84 
 
 
547 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  33.27 
 
 
530 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.72 
 
 
525 aa  291  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  34.29 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  34.25 
 
 
520 aa  280  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  33.39 
 
 
522 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.5 
 
 
527 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.96 
 
 
527 aa  273  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.47 
 
 
523 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  32.84 
 
 
539 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.78 
 
 
551 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.06 
 
 
537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  36.67 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  38.21 
 
 
539 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.62 
 
 
519 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  35.23 
 
 
542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.46 
 
 
580 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  31.34 
 
 
529 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.63 
 
 
590 aa  240  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  31.03 
 
 
576 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  35.11 
 
 
543 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 
509 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.52 
 
 
552 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  36.08 
 
 
552 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
552 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.3 
 
 
593 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
552 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
552 aa  236  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
552 aa  236  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 
600 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  36.08 
 
 
552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.89 
 
 
595 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 
587 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 
569 aa  231  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 
579 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
587 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.77 
 
 
576 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.77 
 
 
579 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.77 
 
 
579 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.77 
 
 
579 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 
603 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 
572 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.7 
 
 
611 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.7 
 
 
611 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.58 
 
 
567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 
563 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  32.3 
 
 
568 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 
677 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 
587 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 
587 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 
587 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  32.31 
 
 
544 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  33.76 
 
 
548 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 
565 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
598 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  32.31 
 
 
544 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 
570 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
546 aa  223  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.11 
 
 
587 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 
570 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 
563 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 
570 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  30.95 
 
 
580 aa  219  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  34.67 
 
 
536 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  37.57 
 
 
547 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 
570 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  31.1 
 
 
559 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  31.19 
 
 
559 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  31.44 
 
 
579 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  30.55 
 
 
553 aa  218  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 
560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
568 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 
504 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  30.25 
 
 
567 aa  217  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 
544 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  35.96 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>