271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0545 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 551 aa  1109    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  47.22 
 
 		 552 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  41.56 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  41.12 
 
 		 540 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  41.92 
 
 		 532 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  41.79 
 
 		 538 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  42.65 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  41.27 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  40.69 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  37.66 
 
 		 538 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  39 
 
 		 525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  38.77 
 
 		 539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 		 551 aa  349  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  38.67 
 
 		 541 aa  349  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  37.97 
 
 		 540 aa  345  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  37.79 
 
 		 540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  38 
 
 		 547 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  36.9 
 
 		 547 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  33.93 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  36.73 
 
 		 527 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  34.05 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.87 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  35.81 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  36.4 
 
 		 527 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  33.51 
 
 		 533 aa  262  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  33.9 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  37.36 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  33.46 
 
 		 538 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.18 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  34.19 
 
 		 519 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.71 
 
 		 600 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  33.72 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.62 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  37.53 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.52 
 
 		 587 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  36.19 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  36.19 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  36.19 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.92 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.27 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  35.57 
 
 		 603 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.61 
 
 		 590 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  35.73 
 
 		 598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  35.73 
 
 		 598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  35.73 
 
 		 598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  35.73 
 
 		 598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  36.3 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  36.3 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  36.3 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.16 
 
 		 587 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  32.16 
 
 		 572 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  31.06 
 
 		 561 aa  240  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  37.75 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  34.34 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  30.51 
 
 		 568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  32.55 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  32.65 
 
 		 567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  32.49 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  32.14 
 
 		 546 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  36.29 
 
 		 548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 		 611 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 		 611 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  36.22 
 
 		 568 aa  233  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  36.9 
 
 		 539 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  35.24 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  30.6 
 
 		 594 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  30.52 
 
 		 595 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 		 588 aa  230  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  30.74 
 
 		 557 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  30.27 
 
 		 542 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  35.68 
 
 		 558 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  30.97 
 
 		 547 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  33.79 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  31.05 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  35.27 
 
 		 571 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  31.05 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 579 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.33 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  30.3 
 
 		 594 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  30.92 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  30.92 
 
 		 559 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  37.56 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  31.92 
 
 		 592 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  30.5 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  30.53 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  31.72 
 
 		 592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  34.43 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>