280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2408 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 521 aa  1051    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  49.05 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  39.78 
 
 		 518 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  43.28 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  44.44 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.08 
 
 		 519 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.35 
 
 		 530 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  33.14 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  36.57 
 
 		 527 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  31.61 
 
 		 527 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.35 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  37.23 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  33.27 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.2 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  31.63 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  33.46 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  34.83 
 
 		 524 aa  239  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  35.63 
 
 		 537 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  30.76 
 
 		 539 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  30.06 
 
 		 503 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  33.18 
 
 		 538 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  35.9 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  33.83 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  32.75 
 
 		 504 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  30.21 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.72 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  28.15 
 
 		 541 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  28.52 
 
 		 540 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  28.79 
 
 		 593 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  35.07 
 
 		 551 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  30.94 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  32.95 
 
 		 536 aa  209  9e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  30.76 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  29.49 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.88 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  29.63 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  29.95 
 
 		 574 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  30.46 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  27.86 
 
 		 535 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 		 587 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  32.75 
 
 		 551 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  30.65 
 
 		 532 aa  206  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 600 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  32.54 
 
 		 559 aa  206  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.43 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  33.84 
 
 		 677 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  28.23 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  31.11 
 
 		 565 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  33.66 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  28.47 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  28.54 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  27.74 
 
 		 590 aa  196  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.39 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  27.55 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 		 532 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  29.51 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  28.95 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  29 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  28.95 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  27.63 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  30.16 
 
 		 566 aa  193  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.04 
 
 		 567 aa  194  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  32.11 
 
 		 535 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  31.78 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.29 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  28.49 
 
 		 570 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.04 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 552 aa  189  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.81 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  28.35 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.35 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.33 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 571 aa  187  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  27.74 
 
 		 576 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  32.61 
 
 		 530 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  32.35 
 
 		 580 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  30.32 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 		 567 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  28.93 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>