260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  100 
 
 		 530 aa  1050    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  60.34 
 
 		 534 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2991  flagellar M-ring protein FliF  48.61 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  41.62 
 
 		 559 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  41.11 
 
 		 527 aa  352  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  39.34 
 
 		 533 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  37.34 
 
 		 531 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  37.48 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  35.14 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  34.69 
 
 		 538 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  31.1 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  34.88 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  32.41 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  29.25 
 
 		 525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  29.14 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  36.41 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  30.73 
 
 		 522 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  29.87 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.02 
 
 		 600 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  29.5 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  35.51 
 
 		 505 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.68 
 
 		 527 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.46 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  29.86 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  29.57 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  28.38 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.55 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  31.68 
 
 		 519 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  32.46 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.19 
 
 		 590 aa  203  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  34.32 
 
 		 587 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  33.51 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.45 
 
 		 551 aa  200  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  31.09 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  28.7 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  27.79 
 
 		 544 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  33.01 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.19 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.01 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.01 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  27.61 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.01 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  30.22 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.54 
 
 		 576 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  29.62 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 		 587 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  31.09 
 
 		 519 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.96 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  34.01 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.01 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  34.26 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  29.33 
 
 		 567 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 		 677 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  30.22 
 
 		 540 aa  190  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 		 518 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  29.35 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 		 592 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  34.39 
 
 		 598 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  29.45 
 
 		 558 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  29.23 
 
 		 592 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 		 561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.6 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  29.74 
 
 		 592 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.25 
 
 		 580 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  27.57 
 
 		 584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  28.94 
 
 		 533 aa  183  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.31 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  27.07 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  27.95 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  31.91 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  34.1 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  28.12 
 
 		 594 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  29.68 
 
 		 611 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  29.68 
 
 		 611 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 		 563 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  27.86 
 
 		 567 aa  180  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.54 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.54 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.75 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  29.56 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>